[发明专利]一种联合利用microRNA及其靶基因内SNP筛选杨树木材品质性状的方法

说明书

本发明提出了预测杨树木材品质性状的方法、杨树选育方法、用于预测杨树木材品质性状的试剂盒、用于预测杨树木材品质性状的设备、杨树选育系统以及预定位点的基因型在预测杨树的木材品质性状中的用途。所述方法包括：(1)确定所述杨树下列预定位点的基因型：Pto‑MIR475b基因的第1929位、Pto‑RPF3‑1基因的第1828位以及Pto‑EMP16基因的第365位；以及(2)基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的木材品质性状，其中，所述Pto‑MIR475b基因的第1929位基因型为GG、Pto‑RPF3‑1基因的第1828位基因型为GG和Pto‑EMP16基因的第365位基因型为GG，是所述杨树的木材品质性状优的指示。利用本发明的方法能够预测出杨树的木材品质性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。

技术领域

本发明涉及生物领域。具体地，本发明涉及一种联合利用microRNA及其靶基因内SNP筛选杨树木材品质性状的方法。更具体地，本发明涉及预测杨树木材品质性状的方法、杨树选育方法、用于预测杨树木材品质性状的试剂盒、用于预测杨树木材品质性状的设备、杨树选育系统以及预定位点的基因型在预测杨树木材品质性状中的用途。

背景技术

杨树是世界上分布最广、适应性最强的树种，是北半球地区广泛栽培的重要用材树种，具有广泛的工业用途，已成为胶合板、纤维板、造纸、火柴以及包装业的重要加工原料，具有重要的经济价值。随着杨树工业用材林定向培育的发展，对杨树新品种也提出了相应要求，需具备优良的木材品质。在杨树优良品种的定向培育中，与造纸有关的材性性状，如木材密度、纤维素、木质素含量以及纤维长度和宽度、微纤丝角等，作为评价木材品质指标的主要参考因素。

分子标记辅助选择育种，是指利用分子标记对育种材料进行选择，是传统遗传育种与现代分子生物学有机结合的育种方法。由于林木生长周期长，然而分子标记辅助选择育种可以在早期进行准确稳定的选择，从而加速育种进程，提高育种效率。在分子育种应用之前，需要鉴定与目标性状关联的分子标记。单核苷酸多态性(SNP)具有数量多、分布广泛、遗传稳定性高、共显性等特点，是目前分子遗传学研究中重要的技术手段。目前，通过对表型和基因型进行联合遗传学研究，利用功能SNP位点对优良种质资源的选择育种，已成为人工林新品种选育的重要方法。

然而，目前利用功能SNP位点对杨树品质性状的选育方法仍有待开发。

发明内容

本发明旨在至少在一定程度上解决现有技术中存在的技术问题至少之一。

在本发明的一个方面，本发明提出了一种预测杨树木材品质性状的方法。根据本发明的实施例，所述方法包括：(1)确定所述杨树下列预定位点的基因型：Pto-MIR475b基因的第1929位、Pto-RPF3-1基因的第1828位以及Pto-EMP16基因的第365位；以及(2)基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的木材品质性状，其中，所述Pto-MIR475b基因的第1929位基因型为GG、Pto-RPF3-1基因的第1828位基因型为GG和Pto-EMP16基因的第365位基因型为GG，是所述杨树的木材品质性状优的指示。发明人发现，Pto-MIR475b基因的第1929位、Pto-RPF3-1基因的第1828位以及Pto-EMP16基因的第365位是与杨树木材品质性状显著关联的SNP位点，通过确定其基因型，能够预测出杨树的木材品质性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，所述预测杨树木材品质性状的方法还可以具有下列附加技术特征：

根据本发明的实施例，在步骤(1)中，确定所述预定位点的基因型是利用第一引物至第九引物进行的，其中，所述第一引物至第九引物分别具有SEQ ID NO：1～9所示的核苷酸序列。发明人发现，利用上述引物，能够确定Pto-MIR475b基因的第1929位、Pto-RPF3-1基因的第1828位以及Pto-EMP16基因的第365位的基因型，从而预测出杨树的木材品质性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。