[发明专利]基于变步长最小均方误差自适应滤波器的基因识别系统有效
申请号: | 201710110410.5 | 申请日: | 2017-02-28 |
公开(公告)号: | CN106919808B | 公开(公告)日: | 2019-06-14 |
发明(设计)人: | 郭睿;徐勇;张健 | 申请(专利权)人: | 哈尔滨工业大学深圳研究生院 |
主分类号: | G16B20/00 | 分类号: | G16B20/00 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 518055 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 步长 最小 误差 自适应 滤波器 基因 识别 系统 | ||
1.一种基于变步长最小均方误差自适应滤波器的基因识别系统,其特征在于,包括变步长最小均方误差自适应滤波器算法改进单元和基因结构多特征加权融合算法处理单元;所述的变步长最小均方误差自适应滤波器算法改进单元,用于通过变步长最小均方误差自适应改进算法对基因序列进行滤波处理,得到随机噪声较少、周期3行为较强的基因特征;所述的基因结构多特征加权融合算法处理单元,用于通过多特征加权融合策略,对基因序列进行特征提取,从而得到表达能力更强的特征向量;
所述基因结构多特征加权融合算法处理单元通过以下步骤进行实现:
1)、在同一统计分析方法下,分别单独使用碱基组成成份特征、碱基位置相关性特征、碱基位置相关性特征、序列周期3特征四种统计特征,训练判别模型并计算其对应的近似相关系数AC的算法评价指标,可记作feaACi,0≤i≤3;
2)、选取四种单一特征指标最小的值,令各个特征的AC指标值分别除以最小指标值做归一化处理,其结果值作为对应特征的权值,表达式记为
其中,feaACi分别对应上述四种统计特征的AC评估指标值,wi表示四种特征归一化后对应的权系数;
3)、将四种特征中的每一个特征量与其对应的权值相乘,组合成一个75维的多特征融合向量继续用于基因识别的算法研究,表达式可记为
其中,feaVeci表示第i个特征向量,wi表示第i个特征对应的权系数,fusionVec表示加权融合后的特征向量,所有的单一特征分量维数不完全同,融合前,需为每一特征量设定固定填充位置,其余位置用0填充,统一扩充到75维。
2.如权利要求1所述的基于变步长最小均方误差自适应滤波器的基因识别系统,其特征在于,所述变步长最小均方误差自适应滤波器算法改进单元通过以下步骤实现:
S1、设计出新的系统输出反馈与步长因子相关联的函数;
S2、利用基因序列GC含量的特征信息对系统输出进行加权。
3.如权利要求2所述的基于变步长最小均方误差自适应滤波器的基因识别系统,其特征在于,所述新的系统输出反馈与步长因子相关联的函数公式定义如下
其中,u0为初始步长,k为常数,且有1≤k<1/u0λmax,λmax为输入信号自相关矩阵最大的特征值。
4.如权利要求2所述的基于变步长最小均方误差自适应滤波器的基因识别系统,其特征在于,所述步骤S2中根据基因序列GC含量与AT含量的比值作为权重重新定义系统的输出,即
其中,Tb>0,分别对应四种碱基的加权系数,且默认有TG=TC=1,TA=TT=1。
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