[发明专利]检测腺癌的蛋白标志/标记

说明书

本申请是申请号为200880013776.X，申请日为2008年3月25日，发明名称为“检测腺癌的蛋白标志/标记”的中国专利申请的分案申请。

技术领域

本发明涉及诊断胰腺腺癌的方法和用于其的生物标记和阵列。

背景技术

在肿瘤学中一个遗留的挑战是关于患者经历肿瘤复发或药物治疗抗性的可能性，或他们存活期望，将他们分级。

胰腺导管腺癌是解剖位置上最致命的恶性肿瘤，单在美国每年有>30,000的新病例和死亡，并且5年的存活是3-5％。这种极高的死亡率是由于缺少有效的早期诊断方法(5)和现存治疗对晚期疾病的不良效果。甚至被诊断有手术可切除肿瘤的患者(10-20％)最终死于复发和转移疾病。因此检测和预测癌症能力的增加对于个体患者的管理是重要的。

抗体微阵列技术(3)具有提供强大的多元分析的潜能(6,7)并且已经建议将其作为技术平台，该平台最终将递送确定的蛋白标志(protein signature)，即从正常患者中区分癌症患者的血清蛋白组合。微阵列技术现在已经成熟到已经克服最初的障碍并且可以分析复杂蛋白质组中的微量蛋白(8-12)。但是癌症的基因表达图谱只在少数病例中证明预测存活时间的能力(1,2)，目前没有将血清蛋白组合与任何上述临床参数联系起来。

能预测存活时间的血清样品分析将允许更个体化的癌症治疗。这对于例如其中没有肿瘤特异的标记存在胰腺腺癌得到强调，虽然大多数患者在诊断时将具有升高的CA 19-9，但是胰腺腺癌，已经显示单独预测标记是非结论性的(4)。另外，非侵入性的方法，例如计算断层摄影术(computed tomography)，没有足够敏感到能检测小的癌，而例如内窥镜超声图像检查法(endoscopic ultrasonography)可以用于观察具有胰腺损伤危险的个体(5)。

与这一背景相反，本发明人现在已经研制了预测性诊断癌症的蛋白质组方法，并鉴定出用于测定胰腺癌和预测存活的第一套血清生物标记。

发明内容

因此，在第一方面，本发明提供一种测定在个体中存在胰腺腺癌的方法，其包括下列步骤：

a)提供需要测试的蛋白样品(例如血清或血浆)；

b)通过测定在测试样品中选自表1中的群组的一个或更多蛋白的存在和/或量而测定测试样品的蛋白标志；

其中在测试样品中的选自表1中的群组的一个或更多蛋白的存在和/或量是胰腺腺癌存在的指征。

“蛋白标志”包括的意思是在具有癌症的个体中存在的血清蛋白存在和/或量的组合，并且其可以区别于存在于未被癌症(例如胰腺腺癌)困扰个体-即正常或健康的个体中的血清蛋白的存在和/或量的组合。

如在随附的实施例中所例证的，存在于测试样品中某些血清蛋白的存在和/或量可以是个体中癌症，例如胰腺腺癌，存在的指征。例如在单一测试样品中某些血清蛋白的相对存在和/或量可以是在个体中癌症，例如胰腺腺癌，存在的指征。

优选地，该个体是人类，但是可以是任何哺乳动物例如家养哺乳动物(优选地是农业或商业上重要的哺乳动物包括马、猪、牛、羊、狗和猫)。

优选地，本发明的第一方面的方法进一步包括下列步骤：

c)提供来自未被胰腺腺癌困扰个体的对照血清或血浆样品；

d)通过测定对照样品中在步骤(b)中测定的一个或更多蛋白的存在和/或量而测定对照样品的蛋白标志；

其中胰腺腺癌的存在是在下面事件中鉴定的：测试样品中在步骤(b)中测定的一个或更多蛋白的存在和/或量与对照样品中步骤(b)中测定的一个或更多蛋白的存在和/或量不同。

优选地，测试样品中在步骤(b)中测定的一个或更多蛋白的存在和/或量与对照样品中在步骤(b)中测定的一个或更多蛋白的存在和/或量显著不同(即统计学上不同)。例如，如在随附的实施例中讨论的，在测试样品和对照样品中特定蛋白的存在和/或量之间的显著不同可以被归类为那些其中p<0.05的差异。

通常，第一方面的方法包括测定在测试样品中在表1中定义的所有蛋白-即在表1中所有19个蛋白的存在和/或量。

或者，第一方面的方法可以包括测定在测试样品中在表1中定义的1或2或3或4或5或6或7或8或9或10或11或12或13或14或15或16或17或18或19个蛋白的存在和/或量。