[发明专利]一种流感病毒弱毒活疫苗毒株的筛选和鉴定方法在审

专利信息
申请号: 201710118851.X 申请日: 2017-03-01
公开(公告)号: CN106939355A 公开(公告)日: 2017-07-11
发明(设计)人: 程根宏 申请(专利权)人: 苏州系统医学研究所
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68
代理公司: 石家庄新世纪专利商标事务所有限公司13100 代理人: 周淑歌
地址: 215123 江苏省苏州市苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 流感病毒 弱毒活 疫苗 筛选 鉴定 方法
【权利要求书】:

1.一种流感病毒弱毒活疫苗毒株的筛选和鉴定方法,其特征在于包括以下步骤:

(1) 利用Mu噬菌体转座子介导的随机插入技术建立M基因的高密度突变库:

利用Finnzymes公司Mu噬菌体转座子介导的随机插入突变试剂盒向流感病毒A/WSN/1933的M基因各个碱基间插入5’-NNNNNTGCGGCCGCA-3’这一15nt长的寡核苷酸序列,从而获得流感病毒M基因的高密度突变库;

(2) 通过流感病毒反向遗传学技术获得病毒突变体库:

用电转化的方法将携有M基因突变体的质粒转化入大肠杆菌DH10B感受体细胞,从重组菌种提取M基因突变体库质粒,然后利用A/WSN/33 H1N1流感病毒8质粒病毒反向遗传学操作系统获取病毒突变体库;

(3) 通过第二代测序技术对病毒突变体库组分进行分析:

取步骤(2)获得的病毒突变体库病毒在MDCK细胞上进行传代,然后利用TRIzol试剂提取病毒RNA,并对各RNA按照反转录试剂盒iScriptTM cDNA Synthesis kit进行反转录产生相应的cDNA,以该cDNA为模板,分别使用3个M基因的特异性正向引物,其序列分别为SEQ ID No.2,SEQ ID No.3,SEQ ID No.4,与Vic标记的插入序列特异性反向引物做PCR扩增,由PCR获得的荧光标记PCR产物设置一次重复和Liz-500分子量标准利用96-毛细管3730xl DNA分析仪进行测序,所产生的数据应用ABI软件进行分析,去除PCR过程、引物及测序仪器产生的非特异性数据;

(4) 小鼠体内筛选流感病毒弱毒活疫苗候选毒株:

首先通过超速离心的方法浓缩突变体库病毒,测定其病毒滴度后用于后续小鼠感染实验,病毒通过滴鼻的方法感染6-8周龄的C57/B6小鼠,分别在感染后第二天、第四天、第六天和第八天收取小鼠的肺脏组织并进行匀浆处理,从肺组织匀浆中用TRIzol试剂提取总RNA,依照上述步骤(3)中方法对样本中病毒M基因进行测序并进行定性和定量分析,根据不同M基因突变病毒在各样本中的存在情况,确定弱毒活疫苗候选毒株;

(5) 弱毒活疫苗候选毒株遗传稳定性和安全性评价:

(a)弱毒活疫苗的分离和表型鉴定:首先对上述弱毒活疫苗候选毒株进行了单克隆化,对其中能在MDCK细胞中能够有效复制的W7-757、W7-791和W7-797三株病毒进行扩增,初步筛选出表现出更好的复制能力和较低的细胞毒性的W7-791病毒;

(b)弱毒活疫苗遗传稳定性检测:将W7-791病毒在MDCK细胞和小鼠体内进行传代,对从细胞或小鼠肺脏匀浆中获得病毒的基因序列中的M基因的序列进行测定, 确定W7-791病毒M基因的突变能够被稳定地遗传下去;

(c)弱毒疫苗的安全性评估:用不同滴度的W7-791病毒免疫6-8周龄小鼠,没发现小鼠产生体重下降及流感症状;给15日龄的新生BALB/c小鼠滴鼻接种不同滴度的W7-791或104 TCID50 的野生型WSN病毒,对小鼠体重和肺脏病变进行检测,W7-791接种小鼠上未观察到像野生型WSN病毒感染小鼠那样的体重下降和肺部病变,由此确定W7-791病毒即为流感病毒弱毒活疫苗毒株。

2.根据权利要求1所述的流感病毒弱毒活疫苗毒株的筛选和鉴定方法,其特征在于:步骤(2)中的电转化的条件是2.0kV、200Ω、25μF。

3.根据权利要求1所述的流感病毒弱毒活疫苗毒株的筛选和鉴定方法,其特征在于:步骤(2)中获取病毒突变体库的具体方法是:培养的HEK293T细胞转至6孔培养板中,待细胞汇合度达到80~90%时,按照转染试剂操作说明,将含插入突变M基因的质粒和含有流感病毒其他7个基因片段的质粒等量混合,与转染试剂按比例混匀,室温孵育15 min,逐滴加入HEK293T细胞培养液中,37℃,5%CO2培养箱中培养48 h,收集转染细胞上清,并将病毒接种于MDCK细胞上进行扩增, 感染48小时后收集病毒,将部分病毒冻存以备后用。

4.根据权利要求1所述的流感病毒弱毒活疫苗毒株的筛选和鉴定方法,其特征在于:步骤(3)中PCR使用Novagen的PCR酶 KOD Hot-Start polymerase,PCR的反应条件是预变性95℃,10 min;变性95℃,45s;退火52℃,30s;延伸72℃,90s;运行30个循环;最后72℃延伸10 min。

5.根据权利要求1所述的流感病毒弱毒活疫苗毒株的筛选和鉴定方法,其特征在于:步骤(4)中确定弱毒活疫苗候选毒株的标准为:病毒在感染后能够在小鼠肺部有效地复制,但在感染后6-8天时被机体清除。

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