[发明专利]一种确定鸭Hsp90α蛋白结合磷脂酰胆碱区域的方法在审
申请号: | 201710120450.8 | 申请日: | 2017-03-02 |
公开(公告)号: | CN106916841A | 公开(公告)日: | 2017-07-04 |
发明(设计)人: | 李鹏鹏;张牧晗;邹烨;孙芝兰;孙冲;耿志明;王道营;徐为民 | 申请(专利权)人: | 江苏省农业科学院 |
主分类号: | C12N15/70 | 分类号: | C12N15/70;C12N15/62;C12N1/21;G01N33/68;G01N21/59;C12R1/19 |
代理公司: | 无锡市大为专利商标事务所(普通合伙)32104 | 代理人: | 曹祖良,张仕婷 |
地址: | 210014 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 确定 hsp90 蛋白 结合 磷脂 胆碱 区域 方法 | ||
1.一种确定鸭Hsp90α蛋白结合磷脂酰胆碱区域的方法,其特征是步骤如下:
(1)鸭Hsp90α基因及各片段基因序列的获得:
a、鸭Hsp90α基因提取:取鸭胸肌100mg,提取总RNA,总RNA经电泳检测,采用核酸定量分析仪测定OD260/280比值及浓度,以1μg总RNA为模板,按照cDNA合成试剂盒说明书进行反转录;反转录程序:37℃ 15 min,85℃ 5min,4℃保存,长期保存应放于-20℃;
b、特异性引物的设计:根据北京鸭的Hsp90α基因序列设计系列基因特异性引物,包括:上游引物F,下游引物R,以及分段用特异性引物N-F、N-R、M-F、M-R、C-F和C-R;
c、PCR扩增:以 cDNA为模板进行PCR扩增,PCR产物用1%的琼脂糖凝胶电泳检测;PCR产物纯化回收后连接至pCold1载体,转化至DH5α感受态细胞,将菌液涂在含100μg/mL氨苄青霉素的LB固体培养基上,37℃培养过夜,然后挑取阳性单菌落进行培养,经菌落PCR及双酶切鉴定重组质粒,对正确的重组质粒进行测序,将测序无误的重组质粒分别转化进入表达感受态细胞Transetta2;
(2)融合蛋白原核表达及可溶性分析:以阳性重组质粒转化步骤(1)所得大肠杆菌Transetta2感受态细胞,挑取单菌落接种至5mL含100μg/mL 氨苄的 LB培养基中,37℃,200r/min震荡培养,当菌液浓度OD600值为0.6~0.8时,加入IPTG至终浓度为0.25mM,22℃,200r/min震荡诱导过夜;用不加IPTG诱导的菌液做对照,离心收集沉淀,用PBS重悬沉淀,于超声波细胞破碎仪上破碎4-6min,11000-13000r/min离心4-6min,分别取出上清、沉淀,加入SDS-PAGE 电泳上样缓冲液,95℃加热10min,用12% SDS-PAGE电泳检测融合蛋白是否为可溶性蛋白;
(3)重组融合蛋白的诱导表达及纯化:
d、诱导表达:将步骤(2)鉴定所得能可溶性表达的菌落接种于500mL含LB培养基中进行诱导表达;4400-4600r/min离心14-16min收集菌体,用pH为7.6含有50mM的磷酸盐,150mM的NaCl, 5mM的咪唑的Binding Buffer缓冲液重悬菌体,冰浴条件下超声破碎18-22min,超声参数为:功率20%,超声1s,间停3s;再11000-13000r/min离心28-32min,4℃收集上清,弃菌体沉淀;
e、初步纯化:将步骤d所得上清加入镍亲和层析柱中,用不同浓度的咪唑洗脱液洗脱并收集,蛋白得到初步纯化,取样液加入SDS-PAGE 电泳上样缓冲液,95℃加热10 min,用12% SDS-PAGE电泳检测重组蛋白的表达情况;
f、进一步纯化:将步骤e所得样品用10kDa的超滤管离心浓缩4℃,4000 r/min,10min/次,再用Superdex TM200进一步纯化,然后再次用SDS-PAGE检测纯化的产物并离心浓缩;用考马斯亮蓝染色的方法测定蛋白浓度,并至于-80℃保存;
(4)磷脂酰胆碱脂质体的制备:称取10mg磷脂酰胆碱,用2mL甲醇溶解,加0.5mL含有25mM HEPES,100mM NaCl,pH7.4的HBS缓冲液,在旋转蒸发仪中去除甲醇后加入2mL HBS,在超声波浴中乳化10min,并用HBS定溶到10mL,再-80℃反复冻融3次得到1mg/mL的脂质体;
(5)表面等离子共振技术检测鸭Hsp90α及各片段与磷脂酰胆碱的相互作用:
g、生物传感芯片L1的准备:将L1芯片安装到Biacore X100 Plus系统中,所有用到的溶液都经过0.22μm滤膜过滤;用50 mM NaOH:异丙醇体积比2:3,的混合溶液清洗3次,每次1min,流速设定为10μL·min-1;再用pH7.4的HBS缓冲液清洗系统及芯片,流速设定为10μL·min-1;
h、待基线平稳后,进行以下步骤:注入30μL 配好的脂质体,使脂质体偶联的L1芯片上,流速1μL·min-1;注入50mM NaOH洗掉未偶联的脂质体1min,流速10μL·min-1;用0.1mg/mL BSA检查芯片的亲脂基团是否饱和,如果没有BSA结合,证明L1芯片已经被脂质体饱和,用HBS缓冲液平衡芯片到基线平稳;稀释至少5个浓度的蛋白,注入到芯片上,流速30μL·min-1;每次上完样,用合适浓度的NaOH再生芯片。
2.如权利要求1所述确定鸭Hsp90α蛋白结合磷脂酰胆碱区域的方法,其特征是:步骤(1)b所述特异性引物如下:
上游引物F:5'-CTCGGATCCATGCCTGAGGCTG T-3',下划线是BamH1酶切位点;
下游引物R:5'-TACGTCGACATCCACCTCCTCCAT-3',下划线是Sal1酶切位点;
N-F:5'-TTGGGATCCATGCCTGAGGCTGT-3';
N-R:5'-GACGTCGACGAGCCTGATAGGAT-3';
M-F:5'-CAGGGATCCATGGAGAAGTACATCG-3';
M-R:5'-GACGTCGACAGAAACCAGGGTCT-3';
C-F:5'-CCGGGATCCATGGAAGAAGAGAAAAAG-3';
C-R:5'-TACGTCGACATCCACCTCCTCCAT-3'。
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