[发明专利]一种突变的COL4A5基因及其应用

说明书

本发明公开了一种突变的COL4A5基因及其应用。一种用于检测Alport综合征的突变的COL4A5基因，COL4A5基因的突变使编码的IV型胶原α5第1371位丝氨酸突变为终止子，导致截短的IV型胶原α5链。本发明所述的突变的COL4A5基因或者所述的突变的IV型胶原蛋白α5链在制备AS检测试剂或检测设备中的应用。所述的检测设备进一步优选包括含有检测突变的COL4A5基因的基因芯片的检测平台。本发明提供了AS新的致病基因的致病位点，为该疾病的诊断提供了新的分子生物学基础。

技术领域

本发明属于生物医药领域，涉及一种突变的COL4A5基因及其应用。

背景技术

Alport综合征(alport syndrome，AS)是一种以进行性肾功能减退和肾小球基底膜结构异常伴神经性耳聋和眼病为临床特征的遗传性肾病。目前认为AS有三种遗传方式：X连锁显性遗传(XL；约占80％)，常染色体隐性遗传(AR；约占15％)和常染色体显性遗传(AD；极少数)，分别由编码Ⅳ型胶原不同α链的基因COL4A5(或COL4A5和COL4A6)、COL4A3和(或)COL4A4突变所致。

X连锁遗传致病基因有COL4A5(或COL4A5和COL4A6)，COL4A5定位于Xq22，是与AS联系最紧密的基因，自第一个COL4A5突变发现以来，已有400多种基因突变在欧洲、亚洲地区和美国相继报道，突变类型多种多样。COL4A6和COL4A5基因头对头相邻位于X染色体上，有学者认为单独的COL4A6基因突变不会导致AS的发生。目前还没有发现COL4A6基因单独的变异的情况，COL4A6基因突变均伴有COL4A5基因异常，出现AS伴弥漫性平滑肌瘤。

常染色体遗传致病基因有COL4A3和(或)COL4A4。这些患者既可为该基因突变的复合杂合子或纯合子，又可为杂合子。文献报告的所检测得到的COL4A3基因突变均为点突变，且突变位置分布于整个基因、无明显的热点突变，突变类型多种多样。已报道的在AR的AS家系中发现的COL4A4基因突变也均为点突变，且突变位置分布于整个基因、无明显的热点突变，突变类型多种多样。

由于AS具有高度的临床和遗传异质性，传统的Sanger基因检测方法需要消耗大量的时间与成本。因此，开发高效、快捷、经济、可同时对多个已知致病基因进行突变检测的方法对其临床诊断非常重要。明确受检人的致病基因和突变，实现对AS的准确诊断、个性化治疗以及产前诊断。

发明内容

本发明的目的是针对AS，提供一种突变的基因COL4A5。

本发明的另一目的在于提供该基因在制备AS诊断试剂中的应用。

本发明的目的可通过如下技术方案实现：

一种用于检测Alport综合征的突变的COL4A5基因，COL4A5基因的突变使编码的IV型胶原α5第1371位丝氨酸突变为终止子，导致截短的IV型胶原α5链。

所述的突变的COL4A5基因，野生型COL4A5基因在Ensemble数据库中的基因编号为：ENSG00000188153，突变的COL4A5基因在物理位置107925013处碱基C缺失，导致移码框偏移，产生了提前的终止子，其他部分与野生型相同。

一种突变的IV型胶原蛋白α5链，野生型IV型胶原蛋白α5链在Ensemble数据库中的基因转录本编号为：NM_033380.2，突变的IV型胶原蛋白α5链在该野生型蛋白的第1371位氨基酸由丝氨酸突变为终止子,其他部分与野生型相同。

本发明所述的突变的COL4A5基因或者所述的突变的IV型胶原蛋白α5链在制备Alport综合征疾病检测试剂或检测设备中的应用。

所述的检测试剂优选：引物或引物对、探针、抗体、或核酸芯片中的一种或多种。

所述的检测设备进一步优选包括含有检测突变的COL4A5基因的基因芯片的检测平台。