[发明专利]CYP2D6基因检测试剂盒及检测方法在审

专利信息
申请号: 201710154082.9 申请日: 2017-03-15
公开(公告)号: CN108018340A 公开(公告)日: 2018-05-11
发明(设计)人: 盛司潼;高虹 申请(专利权)人: 广州康昕瑞基因健康科技有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 510000 广东省广州市萝*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: cyp2d6 基因 检测 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.一种CYP2D6基因检测试剂盒,包括用于对含rs1801253位点的核酸片段进行特异性扩增的引物组,其特征在于,所述引物组包括上游引物SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ IDNO:3或SEQ ID NO:4,以及下游引物SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7或SEQ ID NO:8。

2.根据权利要求1所述的基因检测试剂盒,其特征在于,所述基因检测试剂盒还包括接头,所述接头包括接头A、接头B、接头C、接头D中的至少一种;所述接头A由SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10组成;所述接头B由SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:12组成;所述接头C由SEQ IDNO:13和SEQ ID NO:14组成;所述接头D由SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16组成。

3.根据权利要求1所述的基因检测试剂盒,其特征在于,所述基因检测试剂盒还包括测序引物SEQ ID NO:17,所述测序引物用于对含rs1801253位点的文库分子进行测序。

4.根据权利要求3所述的基因检测试剂盒,其特征在于,所述测序引物的5’末端经过磷酸化修饰。

5.一种基因检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

A、利用扩增引物组,对含rs1801253位点的样本进行扩增,得扩增产物;其特征在于,所述引物组包括上游引物SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4,以及下游引物SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7或SEQ ID NO:8;

B、在所述扩增产物上连接接头,得到文库分子;

C、采用第二代高通量基因测序技术对所述文库分子进行测序,确定rs1801253位点的基因型。

6.根据权利要求5所述的基因检测方法,其特征在于,所述步骤A包括以下步骤:

A1、采用第一引物组扩增CYP2D6基因10号等位基因区域,得第一扩增产物;所述第一引物组包括第一上游引物SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2,以及第一下游引物SEQ ID NO:5或SEQID NO:6;;

A2、以第一扩增产物为模板,采用第二引物组扩增含rs1801253位点的核酸片段,得第二扩增产物;所述第二引物组包括第二上游引物SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4,以及第二下游引物SEQ ID NO:7或SEQ ID NO:8。

7.根据权利要求6所述的基因检测方法,其特征在于,所述步骤B中还包括向第二扩增产物中加入USER酶进行切割的步骤,所述第二扩增产物经USER酶切割形成第一粘性末端。

8.根据权利要求5所述的基因检测方法,其特征在于,所述接头包括接头A、接头B、接头C、接头D中的至少一种;所述接头A由SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10组成;所述接头B由SEQID NO:11和SEQ ID NO:12组成;所述接头C由SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14组成;所述接头D由SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16组成。

9.根据权利要求5所述的基因检测方法,其特征在于,步骤C中用于对含rs1801253位点的文库分子进行测序的测序引物为SEQ ID NO:17。

10.根据权利要求9所述的基因检测方法,其特征在于,所述测序引物的5’末端经过磷酸化修饰。

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