[发明专利]CYP2D6基因检测试剂盒及检测方法在审
申请号: | 201710154082.9 | 申请日: | 2017-03-15 |
公开(公告)号: | CN108018340A | 公开(公告)日: | 2018-05-11 |
发明(设计)人: | 盛司潼;高虹 | 申请(专利权)人: | 广州康昕瑞基因健康科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 510000 广东省广州市萝*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | cyp2d6 基因 检测 试剂盒 方法 | ||
1.一种CYP2D6基因检测试剂盒,包括用于对含rs1801253位点的核酸片段进行特异性扩增的引物组,其特征在于,所述引物组包括上游引物SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ IDNO:3或SEQ ID NO:4,以及下游引物SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7或SEQ ID NO:8。
2.根据权利要求1所述的基因检测试剂盒,其特征在于,所述基因检测试剂盒还包括接头,所述接头包括接头A、接头B、接头C、接头D中的至少一种;所述接头A由SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10组成;所述接头B由SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:12组成;所述接头C由SEQ IDNO:13和SEQ ID NO:14组成;所述接头D由SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16组成。
3.根据权利要求1所述的基因检测试剂盒,其特征在于,所述基因检测试剂盒还包括测序引物SEQ ID NO:17,所述测序引物用于对含rs1801253位点的文库分子进行测序。
4.根据权利要求3所述的基因检测试剂盒,其特征在于,所述测序引物的5’末端经过磷酸化修饰。
5.一种基因检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
A、利用扩增引物组,对含rs1801253位点的样本进行扩增,得扩增产物;其特征在于,所述引物组包括上游引物SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4,以及下游引物SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7或SEQ ID NO:8;
B、在所述扩增产物上连接接头,得到文库分子;
C、采用第二代高通量基因测序技术对所述文库分子进行测序,确定rs1801253位点的基因型。
6.根据权利要求5所述的基因检测方法,其特征在于,所述步骤A包括以下步骤:
A1、采用第一引物组扩增CYP2D6基因10号等位基因区域,得第一扩增产物;所述第一引物组包括第一上游引物SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2,以及第一下游引物SEQ ID NO:5或SEQID NO:6;;
A2、以第一扩增产物为模板,采用第二引物组扩增含rs1801253位点的核酸片段,得第二扩增产物;所述第二引物组包括第二上游引物SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4,以及第二下游引物SEQ ID NO:7或SEQ ID NO:8。
7.根据权利要求6所述的基因检测方法,其特征在于,所述步骤B中还包括向第二扩增产物中加入USER酶进行切割的步骤,所述第二扩增产物经USER酶切割形成第一粘性末端。
8.根据权利要求5所述的基因检测方法,其特征在于,所述接头包括接头A、接头B、接头C、接头D中的至少一种;所述接头A由SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10组成;所述接头B由SEQID NO:11和SEQ ID NO:12组成;所述接头C由SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14组成;所述接头D由SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16组成。
9.根据权利要求5所述的基因检测方法,其特征在于,步骤C中用于对含rs1801253位点的文库分子进行测序的测序引物为SEQ ID NO:17。
10.根据权利要求9所述的基因检测方法,其特征在于,所述测序引物的5’末端经过磷酸化修饰。
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