[发明专利]一种用于沙冬青鉴定的微卫星分子标记、试剂盒及其应用有效
申请号: | 201710165417.7 | 申请日: | 2017-03-20 |
公开(公告)号: | CN106636453B | 公开(公告)日: | 2020-05-12 |
发明(设计)人: | 路战远;智颖飙;程玉臣;张德健;王建国;叶雪松;张向前;咸丰 | 申请(专利权)人: | 内蒙古自治区农牧业科学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 王加贵 |
地址: | 010070 内蒙古自治区呼和浩*** | 国省代码: | 内蒙古;15 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 冬青 鉴定 卫星 分子 标记 试剂盒 及其 应用 | ||
本发明提供了用于鉴定沙冬青的微卫星分子标记,包括AM‑4,所述AM‑4的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明还提供了一种用于鉴定沙冬青微卫星分子标记的试剂盒,包括所述用于鉴定沙冬青的微卫星分子标记对应的引物对。本发明提供的用于鉴定沙冬青的微卫星分子标记以及用于鉴定沙冬青的试剂盒能够有效的鉴别沙冬青。本发明提供的用于鉴定沙冬青的微卫星分子标记还能够为沙冬青种质资源的遗传多样性调查、种群遗传结构分析、个体识别以及亲缘关系鉴定提供支持。
技术领域
本发明涉及分子生物学DNA标记技术与应用领域,具体涉及一种用于沙鉴定冬青及遗传学分析的微卫星分子标记、试剂盒及其应用。
背景技术
沙冬青(Ammopiptanthus mongolicus),属于豆科沙冬青属又称蒙古黄花木、冬青、蒙古沙冬青,分布于内蒙古、宁夏和甘肃等地海拔1000至1200米低山地带,是我国北方荒漠地区唯一的强旱生常绿阔叶灌木,因为具有极强的抗逆性,沙冬青是极其珍贵的荒漠地区种质资源。沙冬青物种历史久远,是古地中海退缩、气候旱化过程中幸存的孑遗种之一。在研究第三纪气候特征、地理环境变迁、亚洲中部荒漠植被的起源和形成等方面有重要的研究价值。
由于分布范围狭小,生境严酷,又受到人类活动的影响,沙冬青数量正不断减少,现已濒临灭绝,被列为国家二级保护植物。在阻止盗采和人为破坏等事件中,快速而准确的物种鉴定和个体识别手段是十分必要的。另外,为了制定合理的保护管理方法及辅助育种,也亟需对沙冬青开展种质资源遗传多样性、种群结构、种群历史动态等遗传学分析研究。
微卫星DNA(Microsatellite DNA),也称为简单重复序列(Simple SequenceRepeats,SSR),广泛分布于真核生物的基因组中,是一类由几个核苷酸(一般为2-6个)为重复单位组成的串联重复序列。由于其有数量多、特异的PCR扩增、稳定性好、在基因组内分布均匀、多态性信息丰富、易于检测等特性等诸多优点成为近年来应用广泛的分子标记之一。微卫星分子标记也成功和广泛得应用于物种鉴定和遗传学研究中。
发明内容
有鉴于此,本发明的目的在于提供一组用于沙冬青鉴定的微卫星分子标记。
为了实现上述发明目的,本发明提供以下技术方案:
本发明提供了用于鉴定沙冬青的微卫星分子标记,包括AM-4,所述AM-4的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
优选的,所述微卫星分子标记还包括AM-6、AM-7、AM-8、AM-10、AM-15、AM-16、AM-17、AM-19和AM-20中的一种或几种,上述核苷酸序列分别如SEQ ID NO.2~10所示。
本发明提供了一种用于鉴定沙冬青的试剂盒,包括根据上述技术方案所述微卫星分子标记设计得到的浓度为10μM的引物对各1μL,2×Taq PCR SuperMix 15μL,DNA模板1μL,用超纯水补齐至30μL;
所述引物对包括:
AM-4引物对序列如SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12所示。
优选的,所述试剂盒还包括以下引物对中的一对或多对:
AM-6引物对序列如SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.14所示;
AM-7引物对序列如SEQ ID NO.15和SEQ ID NO.16所示;
AM-8引物对序列如SEQ ID NO.17和SEQ ID NO.18所示;
AM-10引物对序列如SEQ ID NO.19和SEQ ID NO.20所示;
AM-15引物对序列如SEQ ID NO.21和SEQ ID NO.22所示;
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