[发明专利]一种直接对微小核糖核酸675(microRNA675)进行半定量的试剂盒在审
申请号: | 201710173785.6 | 申请日: | 2017-03-22 |
公开(公告)号: | CN106834512A | 公开(公告)日: | 2017-06-13 |
发明(设计)人: | 魏敏杰;张晶;吴慧哲;陈秋晨 | 申请(专利权)人: | 中国医科大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 沈阳世纪蓝海专利事务所(普通合伙)21232 | 代理人: | 侯志奇 |
地址: | 110122 辽*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 直接 微小 核糖核酸 675 microrna675 进行 定量 试剂盒 | ||
1.一种可直接对微小核糖核酸675(microRNA675)进行半定量的试剂盒,用于对总RNA中的某一种微小核糖核酸675(microRNA675)进行半定量检测,其特征在于:所述的一种可直接对微小核糖核酸675(microRNA675)进行半定量的试剂盒包含的一种具有“由多功能茎环结构维持的单侧3’悬端双螺旋结构”的探针和一种含DNA链置换酶的杂交缓冲液。
2.根据权利要求1所述的一种可直接对微小核糖核酸675(microRNA675)进行半定量的试剂盒,其特征在于:所述的一种具有“由多功能茎环结构维持的单侧3’悬端双螺旋结构”的探针由A、B链两条长度不同的寡核苷酸单链组装而成,A链较长,B链较短,其中A链核苷酸序列为SEQ ID NO.1: 5’ROX-GCCTCGGTGAGCGGTGAGGGCATACAGCCGAGGCT(-BHQ2)CTCCAGACGTCACTCAGTGCACC-3’, 序列中的ROX为荧光基团,BHQ2为淬灭基团;B链的核苷酸序列为SEQ ID NO.2:5’-GGTGCACTGAGTGACGTCTGGAGAG-3’;探针初始的“由多功能茎环结构维持的单侧3’悬端双螺旋结构”不是DNA链置换酶能够催化的空间结构,而变形后的一种“单链-双链-单链-双链”不完整双螺旋结构是DNA链置换酶能够催化的空间结构。
3.根据权利要求1所述的一种可直接对微小核糖核酸675(microRNA675)进行半定量的试剂盒,其特征在于:所述的一种含DNA链置换酶的杂交缓冲液,杂交温度在55-65 ℃之间,由Bst 2.0 WarmStart DNA Polymerase 32 U、MgSO4 10 mM、dNTP Mix 1 mM/种、Tris-HCl 20 mM、(NH4)2SO4 10 mM、KCl 50 mM组成,其中MgSO4 浓度可以在5-20 mM之间调整;在该杂交条件下,能够触发探针从初始“由多功能茎环结构维持的单侧3’悬端双螺旋结构”变形为一种“单链-双链-单链-双链”不完整双螺旋结构的唯一条件是探针的“多功能茎环结构”中的外环结构与微小核糖核酸675(microRNA675)发生特异性结合。
4.根据权利要求1或2所述的一种可直接对微小核糖核酸675(microRNA675)进行半定量的试剂盒,其特征在于:所述的一种具有“由多功能茎环结构维持的单侧3’悬端双螺旋结构”的探针的荧光基团与淬灭基团的修饰位置,荧光基团修饰在探针A链的5’端核苷酸上,淬灭基团修饰在5’端的互补位核苷酸或相邻的核苷酸上;这样修饰后,探针在初始的“由多功能茎环结构维持的单侧3’悬端双螺旋结构”时,荧光基团与淬灭基团空间距离小于10nm,将会发生荧光共振能量转移,导致荧光被淬灭,故探针在初始的“由多功能茎环结构维持的单侧3’悬端双螺旋结构”时,因此检测不到荧光。
5.当探针变形为一种“单链-双链-单链-双链”不完整双螺旋结构时,荧光基团与淬灭基团之间空间距离远大于10 nm,不能发生荧光共振能量转移,荧光基团不能被淬灭,故可检测到荧光;每当“靶序列的出现→与探针结合→探针变形→链延伸→链置换→靶序列重新游离”循环反应一次,被打开探针的量就增加一个靶序列原始量,靶序列的原始量越大,单位时间内发出荧光的探针量就越大,即荧光强度的累积速率与靶序列浓度成正比;因此,探针具有自身信号放大功能,极微量靶序列的存在也能够被检测到,不需要进行扩增。
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