[发明专利]一种基于图像分析的肿瘤细胞DNA含量检测方法在审

专利信息
申请号: 201710194003.7 申请日: 2017-03-28
公开(公告)号: CN106875393A 公开(公告)日: 2017-06-20
发明(设计)人: 邱敦国;谢丹 申请(专利权)人: 四川大学
主分类号: G06T7/00 分类号: G06T7/00;G06T5/40;G06T7/10
代理公司: 成都睿道专利代理事务所(普通合伙)51217 代理人: 潘育敏
地址: 610065 四*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 图像 分析 肿瘤 细胞 dna 含量 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种基于图像分析的肿瘤细胞DNA含量检测方法,其特征在于:

发明进行检测所需的硬件设备包括显微镜、摄像头、计算机和打印机;摄像头安装在显微镜上部,通过显微镜摄像接口与显微镜相连,对显微镜下观察到的视野进行图像采集;摄像头通过数据连接线连接到计算机的USB端口,将摄像头观察到的病理切片图像传输到计算机;打印机通过USB端口和计算机相连;

肿瘤细胞DNA含量检测,包括长度标定、背景校准、正常二倍体细胞测量、肿瘤细胞测量、DNA报告生成五个步骤:首先将一个核准的透光载玻片刻度尺放到显微镜载物台上,通过摄像头,将透光载玻片刻度尺图像拍摄到计算机,按住鼠标左键在刻度尺图像上拖动,分析软件根据拖动刻度的实际长度值与拖动的像素点数,计算出当前显微镜倍数下所采集图像每一个像素点的实际值,完成长度标定;然后将病人标本切片放在显微镜载物台上,通过调整显微镜视野,使当前视野调整到切片中无细胞的空白位置处,通过调整显微镜光亮,使显微镜视野的图像灰度直方图的峰值位于220~230之间,采集当前视野图像并保存,完成背景校准操作;随后,在显微镜下选择具有典型正常二倍体细胞的视野,将病人正常二倍体细胞的图像采集进计算机,通过图像分割,将细胞核从背景中分割出来,计算出正常二倍体细胞细胞核的平均光密度值;紧接着移动显微镜的X轴与Y轴,选择多个具有病变细胞的视野,分别采集每个视野的图像并保存,对每个视野的细胞核进行图像分割,根据细胞核与背景颜色灰度值差异,将细胞核从背景中分割出来,计算分割出细胞核中每个细胞核的平均光密度值和DNA指数DI,生成DNA直方图和散点图;最后,根据检测的结果,生成DNA检测报告,形成诊断建议;

具体流程是:长度标定、背景校准、正常二倍体细胞测量、肿瘤细胞测量、DNA报告生成五个步骤:首先采集刻度尺图像、进行长度标定;采集背景图像、测量背景图像像素点灰度值;采集正常二倍体细胞图像,对二倍体细胞图像进行图像分割,测量二倍体细胞核的灰度值,计算二倍体细胞核的平均光密度值;采集肿瘤细胞图像,对肿瘤细胞进行图像分割,测量每个肿瘤细胞核像素点的光密度值,计算每个肿瘤细胞核的DI值和面积;生成DNA直方图和散点图,按DI 分类统计各类细胞的数量,生成DNA检测报告。

2.如权利要求1所述的基于图像分析的肿瘤细胞DNA含量检测方法,其特征在于:长度标定的具体步骤是:首先将一个核准的透光载玻片刻度尺放到显微镜载物台上,通过摄像头,将刻度尺图像拍摄到计算机,按住鼠标左键在刻度尺图像上拖动,分析软件根据拖动刻度的实际值与拖动的像素点数,计算出当前显微镜倍数下所采集图像每一个像素点的实际长度值,完成长度标定。

3.如权利要求1所述的基于图像分析的肿瘤细胞DNA含量检测方法,其特征在于:所述采集背景图像、测量背景图像像素点灰度值的具体步骤为:将病人标本切片放在显微镜载物台上,首先选择能观察到细胞的视野,调整显微镜焦距,使细胞处于最清晰的位置,然后移动显微镜载物台X轴与Y轴,将显微镜视野调整到切片中没有细胞的空白位置处,通过调整显微镜光亮,分析软件可以获取当前视野图像的像素点灰度值,并将图像灰度值生成灰度直方图,灰度直方图的峰值位于220~230之间,然后采集当前视野图像并保存为背景图像。

4.如权利要求1所述的基于图像分析的肿瘤细胞DNA含量检测方法,其特征在于:所述采集正常二倍体细胞图像,对二倍体细胞图像进行图像分割,测量二倍体细胞核的灰度值,计算二倍体细胞核的平均光密度值的具体步骤是:在显微镜下选择具有正常二倍体细胞的视野,然后通过摄像头将病人正常二倍体细胞的图像采集进计算机,选择图像分割,将细胞核从背景中分割出来,然后用鼠标在分割出的图像中,选择出正常二倍体细胞,并计算出所有正常二倍体细胞核每个像素点的光密度值od_2c(i,j),计算公式为:

其中,grey_2c(i,j)为像素点的灰度值,grey_back(i,j)为背景图像同一位置的灰度值,计算出每个正常二倍体细胞核像素点的光密度值后,计算其平均光密度值mean_od_2c,计算公式如下:

其中N为分割出正常二倍体细胞核所有像素点总数,R为分割出的细胞核区域。

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