[发明专利]一种MZF1蛋白可结合DNA片段及在MZF1活性检测中的应用有效

专利信息
申请号: 201710197698.4 申请日: 2017-03-29
公开(公告)号: CN107058330B 公开(公告)日: 2019-12-20
发明(设计)人: 童强松;郑丽端;王建群;肖文晶;洪梅;叶霖;李聃;宋华杰 申请(专利权)人: 华中科技大学同济医学院附属协和医院
主分类号: C12N15/115 分类号: C12N15/115;C12Q1/66
代理公司: 42250 武汉泰山北斗专利代理事务所(特殊普通合伙) 代理人: 程千慧
地址: 430022 湖北省*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 一种 mzf1 蛋白 结合 dna 片段 活性 检测 中的 应用
【说明书】:

发明涉及一种MZF1蛋白可结合的DNA片段,包含多个MZF1蛋白结合框;还涉及该DNA片段的应用;还涉及一种用于检测细胞内MZF1转录调控活性的方法。通过使用本发明的DNA片段和方法,可直接针对性地检测细胞内MZF1的转录调控活性,而非仅仅检测其转录本或蛋白质的含量,从而使得能够更准确地分析MZF1作为转录因子在一些病理学发展中所起的作用。

技术领域

本发明涉及分子生物学领域,更特别地,涉及一种MZF1蛋白可结合的DNA片段及其在检测细胞内MZF1转录调控活性中的应用。

背景技术

髓样锌指蛋白1(MZF1)是由人类19号染色体MZF1基因编码的一种具有锌指结构的蛋白,属于C2H2类锌指结构蛋白家族,在人类细胞中大量存在。MZF1蛋白全长734个氨基酸,大约82055Da,与靶基因结合后,通过其特有的锌指结构与靶基因启动子区域DNA相结合,在骨髓造血过程中发挥基因激活或抑制效应。

MZF1基因发生突变后,会引起某些调节紊乱,甚至疾病的发生。然而,目前检测细胞内源性MZF1活性仍然依靠Western Blot或者qRCR等技术,虽然灵敏度高,但检测到的只是MZF1蛋白含量的差异,并不能直接体现其结合到靶序列后活性的改变。

因此,需要设计一种新的用于检测细胞内MZF1转录调控活性的方法。

发明内容

发明人通过研究发现,MZF1蛋白结合的DNA序列存在高度的保守性,其结合的DNA核心序列为5'-AGTGGGGA-3'或5’-CGGGNGAGGGGGAA-3’(N表示A、T、C、G,如SEQ ID NO:1-4所示)。

基于以上研究,本发明提供了一种MZF1蛋白可结合的DNA片段,其包含多个MZF1蛋白结合框,其中至少一个MZF1蛋白结合框的序列为5'-AGTGGGGA-3',其余的MZF1蛋白结合框的序列5’-CGGGNGAGGGGGAA-3’(N表示A、T、C、G,如SEQ ID NO:1-4所示)。

优选地,当包含多个MZF1蛋白结合框时,每两个相邻的MZF1蛋白结合框之间具有间隔序列。

优选地,每两个相邻的MZF1蛋白结合框之间的间隔序列为所述间隔序列为TA。

优选地,所述DNA片段的序列如SEQ ID NO:5所示。在研究过程中,我们试验了多种组合,结果发现该序列的DNA片段比其他组合方式对MZF1蛋白的结合效率更高。

本发明还提供了上述DNA片段在检测细胞内MZF1转录调控活性中的应用。

本发明还提供了一种用于检测细胞内MZF1转录调控活性的方法,其包括以下步骤:

S1:将包括上述DNA片段以及连接于所述DNA片段下游的报告基因表达框的报告基因系统导入所述细胞;

S2:通过检测所述报告基因的表达来计算所述细胞内MZF1转录调控活性。可将报告基因的表达强度作为指示MZF1转录调控活性的指标。

优选地,所述报告基因系统为双荧光素酶报告基因系统,包括重组质粒和对照质粒,并且所述重组质粒带有所述DNA片段以及连接在所述DNA片段下游的荧光素酶I的表达框,所述对照质粒带有荧光素酶II的表达框,所示荧光素酶I与所述荧光素酶II激发产生的荧光波长不同。将MZF1转录调控活性表示为荧光素酶I激发产生的荧光强度与荧光素酶II激发产生的荧光强度的比值。

优选地,所述重组质粒通过将所述DNA片段插入至质粒pGL3.0-Basic的Kpn I与Hind III位点之间得到。

优选地,所述对照质粒为phRL-TK。

优选地,S1具体包括:

S11:将所述细胞培养至贴壁,并恢复形态;

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