[发明专利]用来筛查传染病基因和遗传改变的带有条码的微阵列芯片及使用方法

权利要求书

1.一种多重聚合酶链式反应(PCR)与带有条码序列的微阵列芯片的检测系统(BDLF)组合用于筛查和检测传染性微生物或筛查疾病相关基因组突变，包括癌症和遗传疾病的方法：该方法包括：进行第一和第二轮PCR反应；其中，第一轮PCR中使用的引物包含具有下列特性的引物对：除了所测试的靶标特异序列以外，第一引物在5'端含有一个额外的条码序列；而引物对的第二引物含有通用引物序列，与所有引物对一样具有相同序列。

2.根据权利要求1所述的方法，其中，进行第二轮PCR反应使用的引物由独特的条码寡核苷酸引物和通用引物组成；其中，通用引物用报告分子标记，如生物素、荧光染料、荧光纳米颗粒、量子微粒或化学发光染料中的一种。

3.根据权利要求2所述的方法，其中，所述的报告分子可以是任何允许进行PCR产物检测的分子，包括生物素、荧光染料。当生物素被使用时，标记到卵白素或酶联亲和素上的报告分子发射的信号被用于PCR产物检测。

4.根据权利要求2所述的方法，其中，所述的报告分子发射的信号可以是分子，其发出荧光及化学发光，或通过酶促反应发出荧光或化学发光，或像金颗粒一样直接肉眼可见。

5.根据权利要求1所述的方法，其中，在所述的条码微阵列芯片是具有成百上千个点的微阵列芯片，每一个点含有独特的条码寡核苷酸用于捕获第二轮PCR中由通用引物合成的DNA链。

6.根据权利要求5所述的方法，其中，每一个条码序列可以被印刷在不只一个点上；或者，对于每一个条码序列，具有与条码相同的序列但中间有1个或多个核苷酸位点错配的内标寡核苷酸作为条码被印刷在微阵列芯片上；优选的，重复点和内标点被用于测定检测的特异性和可重复性。

7.根据权利要求1或者6所述的方法，其中，所述的条码微阵列芯片被印刷在固体表面作为芯片，或在多梯井道里的固体表面，例如96孔板上。

8.根据权利要求1所述的方法，其中，该方法或者方法所使用的系统可以被用于临床分析中的床边(POC)诊断检测，食品安全和环境监测。

9.根据权利要求1所述的方法，其中，该方法或者方法所使用的系统用于以下检测：引起传染病的微生物是所有引起传染性疾病的微生物，其具有或不具有临床症状。这些传染性微生物中的部分可以引起癌症。

10.根据权利要求1所述的方法，其中，该方法或者方法所使用的系统被用于筛查和检测基因组DNA中的突变，考贝数改变或基表达水平的改变。