[发明专利]一种预测高甘油三酯血症易感性的试剂在审

专利信息
申请号: 201710231226.6 申请日: 2017-04-10
公开(公告)号: CN106811546A 公开(公告)日: 2017-06-09
发明(设计)人: 杨泽;杨帆;朱小泉;孙亮;原慧萍;韩晶;李小玲;赵程;李艳蓉;史晓红;唐雷;贾春媛;万钢;齐科研 申请(专利权)人: 北京医院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12M1/34;C12N15/11
代理公司: 天津欣达睿诚知识产权代理事务所(普通合伙)12216 代理人: 李欣
地址: 100730 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 预测 甘油 三酯血症易 感性 试剂
【说明书】:

技术领域

发明涉及一种预测高甘油三酯血症的易感性的试剂,更具体的说是通过测定与高甘油三酯血症相关基因ADI1的多态性预测受试者对于高甘油三酯血症的易感性,该方法可用于疾病的辅助诊断、治疗和新药开发,属于生物技术领域。

背景技术

高甘油三酯血症(hypertriglyceridemia,HTG)是一种异族性甘油三酯蛋白合成或降解障碍。指血中的甘油三酯以乳糜微粒和前β-脂蛋白中含量升高,是冠心病、高血压、糖尿病等代谢综合征相关疾病发生的重要危险因素。

高甘油三酯血症主要有以下临床表现:

甘油三酯高的后果是容易造成“血稠”,即血液中脂质含量过高导致的血液粘稠,在血管壁上沉积,渐渐形成小斑块,即动脉粥样硬化。而血管壁上的这些块状沉积会逐渐扩大面积和厚度,使血管内径变小、血流变慢,血流变慢又加速了堵塞血管的进程,严重时血流甚至被中断。除了血流中断,阻塞物脱落还能造成血栓;甘油三酯高的后果无论发生在哪个部位,对人体损伤都很严重。如果在心脏,可引起冠心病、心梗;在大脑,可发生脑卒中、中风;发生在眼底,会导致视力下降、失明;如在肾脏,可引起肾衰;发生在下肢,则出现肢体血流不畅导致坏死。

高甘油三酯血症主要通过血液的生化检查来检测。

正常的甘油三酯水平:儿童<100mg/dL(1.13mmol/L),成人<150mg/dL(1.7mmol/L),临界性高甘油三酯血症:250-500mg/dL(2.83-5.65mmol/L),明确的高甘油三酯血症:大于500mg/dL(5.65mmol/L)。

本发明主要针对明确的高甘油三酯血症,即血清甘油三酯水平高于500mg/dL(5.65mmol/L)。

目前主要通过单核苷酸多态性(SNP)位点与甘油三酯水平之间的关联研究来寻找可预测个体高甘油三酯血症的遗传因子。

SNP是指染色体基因组水平上单个核苷酸变异引起的DNA序列多态性,在人群中的频率需>1%,SNPs是双等位基因标记,这种单碱基变化中有70.1%为同型碱基之间的转换:如G/A或T/C,29.1%为发生在嘌呤和嘧啶之间的颠换。C(胞嘧啶)是人类基因组中最易发生变化的位点,因为大多数是甲基化胞嘧啶,能够自发脱氨基转换为T(胸腺嘧啶),SNP包含了已知多态性的80-90%,是最常见的遗传变异。

由于生存的选择压力导致SNP在单一基因和整个基因组中的分布呈不均匀性。SNPs在基因非编码区的数量是编码区的4倍,总数可达三百万个。SNP以其密度高(平均每1kb就有1个)、代表性强(位于基因内部的SNP可能直接影响蛋白质结构或表达水平)、遗传稳定性好(同微卫星多态性比较而言)、易于自动化分析(因SNP在人群中多为双等位基因标记,可简单以“+/-或I/0”直接分型)等特点成为很好的遗传标志。

本领域的研究显示,具体的某个SNP基因型与特定疾病的相关性和预期该疾病的易感性高低之间的关系是非常复杂的。即使是同一基因上的不同SNP位点,与某一疾病的相关性或易感性之间的关系也无从互相参考,甚至同一个SNP位点对于不同人种也存在着显著的甚至是质的差别。

本发明中,我们研究了酸式还原酮加双氧酶Acireductone Dioxygenase 1,ADI1)基因,ADI1基因位于2p25.3,包含5个外显子,其编码产物为一种细胞内加双氧酶,调控细胞内多种基础生物化学反应。目前尚无任何关于ADI1基因与高甘油三酯血症相关联的研究结果。

发明内容

本发明中,我们首次发现了ADI1基因的rs115172984T>C多态性位点的基因型与高甘油三酯血症易感性之间的关系。通过提取宿主细胞的基因组DNA,测定受试者的ADI1基因第1外显子区rs115172984T>C多态性位点的基因型,能够预测受试者对高甘油三酯血症的易感性:ADI1基因第1外显子区rs115172984T/C的基因型为GG时,受试者的易感性最低;携带A等位基因时,受试者的易感性升高。

本发明还提供了一种分离核酸,具有SEQ ID NO:1所示的碱基序列,其+401位即是变异位点,以字母“Y”标示出。该核酸序列为ADI1 rs115172984T/C位点侧翼序列。图1为ADI1基因结构及其多态性变异位点的示意图,附图中包含有5个外显子,rs115172984T/C位点标在ADI1基因图中第1外显子区的相应位置。

本发明的主要目的是提供一种预测高甘油三酯血症易感性的方法。

本发明的的第二个目的是提供一种预测高甘油三酯血症易感性的系统。

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