[发明专利]用于鉴定春夏谷类型的引物对及其应用

说明书

本发明公开了一种用于鉴定春夏谷类型的引物对及其应用。本发明首先保护一种作为分子标记的DNA分子，命名为InDel‑34，如序列表的序列1所示。本发明还保护一种鉴定待测谷子为春谷还是夏谷的方法，包括如下步骤：检测待测谷子基因组中是否具有InDel‑34，如果具有InDel‑34、待测谷子为或候选为夏谷，如果不具有InDel‑34、待测谷子为或候选为春谷。本发明可用于谷子育种，对于选育具有不同抽穗期性状的谷子，对于鉴定未知品种的谷子为春谷还是夏谷，具有重要的应用价值。

技术领域

本发明涉及用于鉴定春夏谷类型的引物对及其应用。

背景技术

作为起源于我国的C₄旱生作物，谷子在我国已经拥有11,500多年的栽培历史，无论在农业生产还是基因功能研究方面正在发挥越来越重要的作用。谷子在我国各地均有分布，曾是我国南到海南岛北到黑龙江，西至新疆西部和东至东海之滨广泛栽培的作物，南北跨度和海拔跨度大。但目前主要分布在长江以北半干旱半湿润和干旱地区，为了适应不同的生态区，谷子从进化上形成了春谷类型和夏谷类型的分化，春谷多适应相对高纬度高海拔地区(东北三省、黄土高原等地区)，夏谷则适应中低纬度和低海拔地区(华北平原以及华北平原以南地区)。春谷春天播种，生育期为120-140天。夏谷夏天播种，生育期为90-110天。生育期即从种子播种到收获子代种子的时间段。

春谷和夏谷最大的区别在于播种和抽穗期的早晚，表现在播种期春谷比夏谷一般提前近30天左右，抽穗期春谷比夏谷一般早20天左右。抽穗指禾谷类作物发育完全的幼穗从剑叶鞘内伸出的时期或状态。记载时常以幼穗中部露出剑叶鞘时作为抽穗标准。全田有10％植株抽穗时记为始穗期，50％植株抽穗时为抽穗期，80％植株抽穗时为齐穗期。在中低纬度地区将春谷和夏谷在同一地点同一时间播种，春谷一般则较夏谷早15-20天左右。春夏类型的划分在谷子品种资源和遗传育种研究中有重要意义，可为资源分类管理、育种亲本和杂交种选配的亲本配置提供重要信息。

发明内容

本发明的目的是提供一种用于鉴定春夏谷类型的引物对及其应用。

本发明首先保护一种作为分子标记的DNA分子，命名为InDel-34，如序列表的序列1所示。

本发明还保护一种鉴定待测谷子为春谷还是夏谷的方法，包括如下步骤：检测待测谷子基因组中是否具有InDel-34，如果具有InDel-34、待测谷子为或候选为夏谷，如果不具有InDel-34、待测谷子为或候选为春谷。

本发明还保护一种鉴定待测谷子的抽穗期性状的方法，包括如下步骤：检测待测谷子基因组中是否具有InDel-34，在平行条件下，基因组中具有InDel-34的待测谷子从出苗到抽穗期所经历的天数多于基因组中不具有InDel-34的待测谷子。

本发明还保护一种试剂盒，包括用于检测待测谷子基因组中是否具有InDel-34的物质；所述试剂盒的功能为如下(a)或(b)：(a)鉴定待测谷子为春谷还是夏谷；(b)鉴定待测谷子的抽穗期性状。

本发明还保护InDel-34作为分子标记的应用。所述应用为如下(a)或(b)：(a)鉴定待测谷子为春谷还是夏谷；(b)鉴定待测谷子的抽穗期性状。

本发明还保护用于检测待测谷子基因组中是否具有InDel-34的物质在制备试剂盒中的应用；所述试剂盒的功能为如下(a)或(b)：(a)鉴定待测谷子为春谷还是夏谷；(b)鉴定待测谷子的抽穗期性状。

本发明还保护一种特异引物对，由引物F1和引物R1组成；所述引物F1为序列表的序列2所示的单链DNA分子；所述引物R1为序列表的序列3所示的单链DNA分子。

本发明还保护所述特异引物对在制备试剂盒中的应用；所述试剂盒的功能为如下(a)或(b)：(a)鉴定待测谷子为春谷还是夏谷；(b)鉴定待测谷子的抽穗期性状。