[发明专利]一种检测III类错合畸形PCDHB3基因突变的PCR引物、探针及方法

说明书

本发明涉及人基因组DNA突变检测技术领域，具体涉及一种检测III类错合畸形PCDHB3基因突变的PCR引物、探针及方法，该PCR引物包括用于扩增PCDHB3基因多态位点的1对共2条引物；该探针包括用于检测PCDHB3基因多态位点的2条探针，每一条探针包含13‑25个碱基的序列，其5’端具有荧光基团标记，3’端具有MGB基团标记。本发明的PCR引物特异性好；本发明的探针特异性好，检测灵敏精确；本发明的荧光定量PCR检测方法可以检测III类错合畸形PCDHB3基因多态性，准确性好，灵敏度高，步骤简单，操作控制方便，检测效率高。

技术领域

本发明涉及人基因组DNA突变检测技术领域，具体涉及一种检测III类错合畸形PCDHB3基因突变的PCR引物、探针及方法。

背景技术

Ⅲ类错合畸形指下颌及下牙弓处于近中位置，磨牙为近中关系，可分为骨性三类和牙性三类错合，是临床上较常见的一种发育性畸形，表现为多种形式的颅颌面的发育异常及牙列的形态异常，包括：前牙对咬合、反合、开合，上颌骨后缩或过小，下颌骨前突或肥大。Ⅲ类错合畸形在中国人群中的患病率很高，北京医科大学于 2000 年调查结果显示,乳牙期、替牙期和恒牙期安氏Ⅲ类错牙合的患病率分别为 14.94%, 9.65%和14.98% 。

Ⅲ类错合畸形对口腔功能、语言功能、颜面美观和心理健康都有较严重的影响。首先，影响口腔功能，造成咀嚼功能障碍，吞咽异常，严重者导致消化不良；其次，影响语言功能，反覆盖越明显，反覆合越小，语音功能异常越明显；再次，影响容貌，表现为颜面中 1/3的凹陷和下颌前突畸形，随着错合牙畸形的严重，颜面呈现新月状面型；更严重的是，它还导致患者精神上的自卑感和孤僻，甚至造成严重的心理、精神障碍。因此，Ⅲ类错牙合的矫治原则是：尽可能及早地发现病情，早期矫治，以阻断畸形的进一步发展，争取相对理想的矫治效果。

III类错合畸形是遗传和外部因素共同作用的多因子复杂疾病。国内外多个研究团队的结果表明，遗传因素在III类错合畸形的发病中起着重要的作用。本研究团队发现，某III类错合畸形家系中患者PCDHB3基因（NM_018937）编码区的1244位置是G，而该家系中不患病的以及其它正常人群中该位点是C。综合其它一些生物信息学分析与文献分析，该位点的突变可能是III类错合畸形的致病因素之一。

发明内容

为了克服现有技术中存在的缺点和不足，本发明的目的在于提供一种检测III类错合畸形PCDHB3基因突变的PCR引物、探针及方法。

本发明的目的通过下述技术方案实现：一种检测III类错合畸形PCDHB3基因突变的PCR引物，包括用于扩增PCDHB3基因多态位点的1对共2条引物，2条引物的序列分别为：

PCDHB3F：5'-AGGCGCGCTGGACAGA-3'

PCDHB3R：5'-GTCGGAGACCAGCACGGTTAT-3'。

一种检测III类错合畸形PCDHB3基因突变的探针，包括用于检测PCDHB3基因多态位点的2条探针，每一条探针包含13-25个碱基的序列，其5’端具有荧光基团标记，3’端具有MGB基团标记。

优选的，所述2条探针的序列分别为：

PCDHB3C：5'-CY5-ACCAGATCCGAGTACA-MGB-3'

PCDHB3G：5'-JOE-ACCAGATGCGAGTACA-MGB-3'。

一种检测III类错合畸形PCDHB3基因突变的试剂盒，包括上述所述的PCR引物和上述所述的探针。

一种用于非治疗目的检测III类错合畸形PCDHB3基因突变的荧光定量PCR检测方法，包括如下步骤：

（1）提取模板DNA：从病人的血液中提取模板DNA；