[发明专利]一种高性能M‑MLV逆转录酶的制备方法在审
申请号: | 201710253825.8 | 申请日: | 2017-04-18 |
公开(公告)号: | CN106906237A | 公开(公告)日: | 2017-06-30 |
发明(设计)人: | 李京;高嵩;陈祉月;罗志丹;龚雪梅;张惠铭;张羽;潘绮雯 | 申请(专利权)人: | 淮海工学院;江苏愚公生命科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/70 | 分类号: | C12N15/70;C12N9/12 |
代理公司: | 连云港润知专利代理事务所32255 | 代理人: | 刘喜莲 |
地址: | 222000 江苏省连云港市海州区*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 性能 mlv 逆转录 制备 方法 | ||
技术领域
本发明涉及一种生物催化剂的制备方法,特别是一种高性能M-MLV逆转录酶的制备方法。
背景技术
现代生物医学建立在分子生物学“中心法则”的基础之上。通过基因表达研究基因功能是现代生物医学的核心问题之一。由于基因表达产物RNA极易降解,因此绝大多数关于基因表达的研究都需要将RNA逆转录为cDNA来作为研究对象。特别是近年来,伴随着高通量测序技术的飞速发展,RNA测序在生物医学前沿研究中得到了广泛的应用,在真核生物的基因表达调控研究、疾病发生机制研究和精准医疗方案确定、动植物遗传育种等众多方面都具有不可估量的潜力。而RNA测序同样需要首先将模板RNA转变为cDNA来构建测序文库。在这些过程中,都需要一种极为重要的生物催化剂——逆转录酶。
逆转录酶(Reverse Transcriptase)是以RNA为模板指导三磷酸脱氧核苷酸合成cDNA的酶。逆转录酶具有3种活性:RNA指导的DNA聚合酶活性,DNA指导的DNA聚合酶活性(这2种活性共用同一个活性中心),以及降解RNA-DNA杂合链中RNA的RNase H活性。在生物医学领域,逆转录酶被广泛用于合成第一链cDNA、制备cDNA文库、RNA测序等。为此,最早发现逆转录酶的美国科学家特明(H. M. Temin)和巴尔的摩(D. Baltimore)共同获得了1970年诺贝尔生理学或医学奖。
合成cDNA的最大挑战在于,在较低的温度下单链RNA容易自身配对形成发夹等复杂二级结构,阻碍逆转录反应的进行;同时,逆转录酶自身具有的RNase H活性会降解模板RNA,导致合成的cDNA被截短。而较高的温度能够打开RNA的二级结构,有利于cDNA的合成。目前,人们仍然缺乏高效率热稳定性逆转录酶作为工具,因此,寻找热稳定性更高的逆转录酶,或者改造提升现在已经发现的逆转录酶的热稳定性十分重要。
最常用于生物医学工具酶的逆转录酶包括莫洛尼鼠白血病病毒(Moloney Murine Leukemia virus,M-MLV)逆转录酶和禽骨髓母细胞瘤病毒(Avian Myeloblastosis Virus,AMV)逆转录酶。M-MLV逆转录酶由一条多肽链构成,包括N端聚合酶结构域和C端RNase H结构域,一般在37°C -42°C下工作,在高温下会很快失活。AMV逆转录酶具有更高的最适反应温度(45°C -50°C),但由于和M-MLV逆转录酶相比,其cDNA合成效率较低、RNase H活性较强,所以应用范围较小。由于野生型M-MLV逆转录酶和AMV逆转录酶在反应温度方面受限,科研人员对于它们的热稳定性和cDNA合成效率的提升改造从未间断。其中一个有效的改造是通过点突变将它们的RNase H活性去除。去除RNase H活性后,它们对于全长cDNA的合成有了很大改善,热稳定性也有了一定提高。M-MLV逆转录酶由单体构成,结构比AMV逆转录酶(由2个亚基构成)更为简单,因此也得到更多的改造尝试。通过分子设计结合高通量筛选的方法,目前已获得了热稳定性高达60°C的M-MLV逆转录酶突变体。
在野生型M-MLV逆转录酶中引入大量随机突变,并使用compartmentalized ribosome display (CRD) evolution in vitro technique技术进行高通量筛选,选出热稳定性提升的突变体。现有报道的最高热稳定性M-MLV逆转录酶耐热能力为60°C。其缺陷在于:由于突变是随机引入的,导致无效突变或失活突变过多,后期筛选工作量大且命中率低。筛选使用的compartmentalized ribosome display (CRD) evolution in vitro technique技术要使用无细胞表达体系,价格昂贵。现有报道的最高热稳定性M-MLV逆转录酶耐热能力为60°C,耐热能力较低。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是针对现有技术的不足,提供一种分子理性设计与功能筛选相结合从而获取高热稳定性的M-MLV逆转录酶的制备方法。
本发明所要解决的技术问题是通过以下的技术方案来实现的。本发明是一种高性能M-MLV逆转录酶的制备方法,其特点是,其步骤如下:
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