[发明专利]海鱼弧菌检测用引物对、试剂盒及检测方法在审
申请号: | 201710264853.X | 申请日: | 2017-04-21 |
公开(公告)号: | CN107099585A | 公开(公告)日: | 2017-08-29 |
发明(设计)人: | 麻丽丹;王殿夫;田卓;王青;冯华炜;吕婷婷 | 申请(专利权)人: | 丹东出入境检验检疫局综合技术服务中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 大连格智知识产权代理有限公司21238 | 代理人: | 刘晓琴,张亚男 |
地址: | 118000 *** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 海鱼 弧菌 检测 引物 试剂盒 方法 | ||
1.海鱼弧菌检测用引物对,其特征在于,碱基序列为SEQ ID NO.1/2。
2.海鱼弧菌检测用试剂盒,包括碱基序列为SEQ ID NO.1/2的引物对。
3.根据权利要求2所述的海鱼弧菌检测用试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括浓度为10~100nmol/L的海鱼弧菌标准菌株的DNA提取物。
4.一种海鱼弧菌的检测方法,其特征在于,所述方法包括以SEQ ID NO.1/2为引物对进行TD-PCR扩增的步骤。
5.权利要求4所述的海鱼弧菌的检测方法,其特征在于,所述TD-PCR扩增以海鱼弧菌gyrB基因941~1370位的核酸序列为靶基因。
6.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于,所述的TD-PCR扩增反应条件为
①94℃预变性4min;
②扩增:94℃30s、69℃30S、72℃1min,2个循环;扩增:94℃30s、68℃30S、72℃1min,2个循环;扩增:94℃30S、67℃30S、72℃1min,2个循环;扩增:94℃30S、66℃30S、72℃1min,2个循环;扩增:94℃30S、65℃30S、72℃1min,2个循环;扩增:94℃30S、64℃30S、72℃1min,2个循环;扩增:94℃30S、63℃30S、72℃1min,2个循环;扩增:94℃30S、60℃30S、72℃1min,18个循环;
③72℃延伸7min,4℃保存。
7.权利要求4所述的海鱼弧菌检测方法,包括如下步骤:
(1)提取待测样品DNA,得到模板液;
(2)TD-PCR扩增:
反应体系:模板液2μL、10×PCR缓冲液2.5μL、dNTP 2μL、Taq酶0.125μL、浓度为10μM的引物对SEQ ID NO.1/2 1μL、补充灭菌双蒸水至总体积为25μL;以上各组分加入至0.2mL PCR反应管中,混匀,5000r/min离心10s;
反应条件:①94℃预变性4min;②扩增:94℃30s、69℃30S、72℃1min,2个循环;扩增:94℃30s、68℃30S、72℃1min,2个循环;扩增:94℃30S、67℃30S、72℃1min,2个循环;扩增:94℃30S、66℃30S、72℃1min,2个循环;扩增:94℃30S、65℃30S、72℃1min,2个循环;扩增:94℃30S、64℃30S、72℃1min,2个循环;扩增:94℃30S、63℃30S、72℃1min,2个循环;扩增:94℃30S、60℃30S、72℃1min,18个循环;③72℃延伸7min,4℃保存;
⑶TD-PCR扩增产物电泳检测:
用电泳缓冲液制备2%琼脂糖凝胶;取步骤⑵所制备的TD-PCR扩增产物5μL,与1μL上样缓冲液混合后点样,用DNA分子量标记物做参照;3V/cm~5V/cm恒压电泳,电泳20min~40min,电泳检测结果用凝胶成像分析系统记录并保存;
⑷结果判定:以海鱼弧菌标准菌株作为阳性对照,以其它非海鱼弧菌菌株作为阴性对照,以灭菌双蒸水为模版作为空白对照进行步骤⑴~⑷的操作;
如待测样品扩增片断大小与阳性对照一致即可判定为阳性,若样品无扩增产物或者产物片段大小不一致即可判定为阴性,阳性扩增片段需进行测序并与参考序列进行比对。
8.权利要求7所述的海鱼弧菌检测方法,其特征在于,所述的步骤⑴模板液的制备方法是:待测样品以3%氯化钠碱性蛋白胨水增菌培养至菌浓度约0.5麦氏浊度时,取1.0mL培养液于13000rpm离心5min,弃上清液,用DNA提取试剂盒处理的模板液,或者取1.0mL培养液于13000rpm离心5min,弃上清液,然后加入100μL灭菌双蒸水振荡混匀后煮沸10min,冷却至室温后13000rpm离心2min,取2μL上清液做模板液。
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