[发明专利]用于鉴定陆地棉早熟性的SSR标记的开发及其应用

说明书

本发明公开了一种用于鉴定陆地棉早熟性的SSR标记的开发及其应用。本发明提供了一种用于鉴定或辅助鉴定棉花早熟性的引物对，为能够扩增得到如下DNA片段的引物对：所述DNA片段是以棉花基因组DNA为模板，采用序列表中序列1和序列2所示引物对进行PCR扩增所得的DNA片段。本发明针对陆地棉D3染色体上定位的QTL位点(qFT‑D3‑3)，开发目标区间内的分子标记，获得与目标QTL紧密连锁的SSR标记，经多群体验证标记与棉花早熟性之间的相关关系，从而用于棉花早熟性的选择应用，为早熟棉花品种的分子标记辅助选择育种提供重要资源。

技术领域

本发明属于生物技术领域，涉及一种用于鉴定陆地棉早熟性的SSR标记的开发及其应用。

背景技术

棉花是世界上非常重要的一种经济作物，在国民经济和社会发展中占有重要地位。但是，由于我国的基本国情是人多地少，粮棉争地矛盾非常突出，植棉面积不断减少，而传统的一年一熟制植棉方式限制了棉花生产的发展。因此，生产上迫切需要适合两熟或多熟种植的早熟、丰产、优质棉花新品种。在四个棉花栽培种之中，陆地棉(Gossypiumhirsutum)年产量占棉花总产量的95％以上。短季棉是陆地棉的一种类型，其最突出的特征是生育期较短，早熟性较好。早熟性是多个复杂性状的综合表现，涉及开花期(FT)、全生育期(WGP)、花铃期(FBP)、果枝始节(NFFB)、果枝始节高度(HNFFB)和株高(PH)等多个数量性状，受多个基因控制，遗传机理复杂且易受环境因素影响。传统的育种方法是通过选配具有相对性状的品种、品系进行杂交，在后代选择优良单株，再培育早熟品种。但是这种育种方法进展缓慢、效率较低，很难满足生产的需要。分子标记辅助选择(Marker-assistedselection,MAS)是一种选择效率高、目的性强、节省时间的新型辅助育种方法。这种方法所需的首要条件是获得与目标性状紧密关联的分子标记。因此，开发与陆地棉早熟性紧密相关的分子标记，是将MAS用于早熟性棉花新品种选育的关键，对促进棉花新品种选育、保证棉花生产在国民经济中的地位具有重要意义。

连锁分析是目前研究植物数量性状基因型的主要方法之一，通过双亲杂交建立作图群体，对群体性状进行高精度的表型鉴定，并进行高密度分子连锁图谱的绘制，再对遗传图谱和表型性状进行连锁分析，发掘与目标性状相关的遗传连锁区段并定位QTL位点。简单重复序列(Simple sequence repeat，SSR)是植物基因组中广泛存在的分子标记，其检测技术操作简单，结果可重复性高，是用于遗传图谱构建、QTL定位的重要标记之一，也是应用于MAS最为广泛的标记。

在前人的研究报道中，利用两个F₂群体连锁分析已定位了生育期、苗期、蕾期、花铃期、果枝始节、果枝始节高度和霜前花率等与陆地棉早熟性状相关的QTL位点(Li,etal.QTL analysis for early-maturing traits in cotton using two upland cotton(Gossypium hirsutum L.)crosses.Breeding Science,2013,63:154-163)。但是，到目前为止，还没有获得鉴定或辅助鉴定棉花早熟性可靠的分子标记，生产中也没有通过MAS开展相关的早熟棉育种工作。

发明内容

本发明的第一个目的是提供一种用于鉴定或辅助鉴定棉花早熟性的引物对。

本发明所提供的用于鉴定或辅助鉴定棉花早熟性的引物对，可为能够扩增得到如下DNA片段的引物对：所述DNA片段是以棉花基因组DNA为模板，采用序列表中序列1和序列2所示引物对进行PCR扩增所得的DNA片段。

具体的，所述引物对由序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA组成。

制备所述引物对的方法也属于本发明的保护范围。

本发明所提供的制备所述引物对的方法具体可包括将所述引物对中的两条单链DNA分别单独包装的步骤。