[发明专利]利用脂质生物标志物预测糖尿病视网膜病变的方法在审
申请号: | 201710313587.5 | 申请日: | 2017-05-05 |
公开(公告)号: | CN107133470A | 公开(公告)日: | 2017-09-05 |
发明(设计)人: | 王文军;陈显扬;萨日娜;马占青;任素玲;段晓波 | 申请(专利权)人: | 北京骐骥生物技术有限公司 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
代理公司: | 北京远大卓悦知识产权代理事务所(普通合伙)11369 | 代理人: | 史霞 |
地址: | 100000 北京市海淀*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 利用 生物 标志 预测 糖尿病 视网膜 病变 方法 | ||
1.一种利用脂质生物标志物预测糖尿病视网膜病变的方法,其特征在于,主要包括以下步骤:
步骤1、筛选出正常人组群和糖尿病视网膜病变组群之间VIP值大于1的排名前6位的差异性化合物,分别为表1所示:
表1
步骤2、利用逻辑回归模型1进行计算,得到TC值,所述逻辑回归模型1的计算公式为:
TC=9.748+(-1.881)R754+(-0.996)R1489+(-2.609)R1604;
步骤3、根据所得TC值进行判断,TC=0为否;TC=1为是。
2.如权利要求1所述的利用脂质生物标志物预测糖尿病视网膜病变的方法,其特征在于,步骤1中利用OPLS-DA模型对差异性化合物进行筛选,筛选条件VIP>1。
3.如权利要求2所述的利用脂质生物标志物预测糖尿病视网膜病变的方法,其特征在于,步骤1中筛选的具体方法为:
步骤1.1将样品进行超高效液相色谱和质谱分析,得到脂质组学数据,将正常人组群和糖尿病视网膜病变组群分别计为CK及ZWSJBB;
步骤1.2对脂质组学数据进行标准化操作,利用OPLS-DA模型对CK及ZWSJBB进行S-plot分布得到S形曲线,并进行强制分组,计算影响CK及ZWSJBB分组的变量重要性,即得VIP值;
步骤1.3按照VIP值大于1的标准得到80个化合物,并将该80个化合物作为与糖尿病视网膜病变相关度最高的差异性化合物;
步骤1.4将所得80个化合物按照VIP值大小从高到低排列,取前6位,即得步骤1中所述差异性化合物。
4.如权利要求1所述的利用脂质生物标志物预测糖尿病视网膜病变的方法,其特征在于,步骤2中TC值或者用逻辑回归模型3进行计算,所述逻辑回归模型3的计算公式为:
TC=8.3594+1.0424R67+0.1048R749+0.2215R751+(-1.2756)R754+(-1.3995)R1250+(-0.9267)R1489+(-2.3387)R1604。
5.如权利要求1所述的利用脂质生物标志物预测糖尿病视网膜病变的方法,其特征在于,步骤2中TC值或者用逻辑回归模型2进行计算,所述逻辑回归模型2的计算公式为:
TC=10.429+(-1.790)R754+(-0.468)R1250+(-0.925)R1489+(-2.597)R1604。
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G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用