[发明专利]小麦穗密度QTL连锁的HRM分子标记及其应用

权利要求书

1.与小麦穗密度QTL Qsd.sau-7A紧密连锁的分子标记，其特征在于，该分子标记为0C32-715，核苷酸序列如SEQ ID No:1所示；分子标记0C32-715与小麦穗密度QTL Qsd.sau-7A之间的遗传距离为8cM，二者共定位于小麦7A染色体标记wPt-5949和wPt-0961之间区段内，小麦穗密度QTL Qsd.sau-7A能增加小麦穗密度值，LOD值为2.67~9.76，解释5.60~7.08%的表型变异。

2.用于荧光定量PCR扩增权利要求1所述分子标记的引物对，其特征在于，包括上游引物和下游引物，序列分别如SEQ ID No:2-3所示。

3.权利要求1所述分子标记在小麦穗密度性状相关育种中的应用。

4.权利要求1所述分子标记在筛选或鉴定携带穗密度Qsd.sau-7A的小麦品种中的应用。

5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，包括以下步骤：

1）提取待测小麦的基因组DNA；

2）以待测小麦的基因组DNA为模板，设计用于荧光定量PCR扩增所述分子标记的引物对，进行荧光定量PCR扩增；所述引物对包括上游引物和下游引物，序列分别如SEQ ID No:2-3所示；

3）根据分析荧光定量PCR后反映的高分辨熔解曲线图，进行基因分型。

6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，步骤2）中荧光定量PCR扩增反应体系：SsoFast EvaGreen超混合液5μL、上游引物和下游引物各300ng、模板DNA100ng、DNase/RNase-free去离子水加至总量为10μL；

荧光定量PCR扩增程序：95℃预变性5min；94℃变性15s、59.1℃退火30s，共50个循环；熔解曲线范围为65~95℃，每0.2℃读一次数，时间为10s。

7.根据权利要求5或6所述的应用，其特征在于，步骤3）利用高分辨熔解曲线进行基因分型，含有小麦穗密度QTL Qsd.sau-7A的小麦品种均出现与西藏半野生小麦Q1028相同的熔解曲线，而不含有小麦穗密度QTL Qsd.sau-7A的小麦品种均出现与西藏半野生小麦Q1028明显不同的熔解曲线。

8.权利要求1所述分子标记在鉴定小麦穗密度QTL Qsd.sau-7A中的应用。

9.权利要求2所述引物对在小麦穗密度性状相关分子标记辅助育种中的应用。