[发明专利]一种利用Cas9/gRNA系统构建扩增子文库的方法有效
申请号: | 201710382859.7 | 申请日: | 2017-05-26 |
公开(公告)号: | CN107058573B | 公开(公告)日: | 2020-07-10 |
发明(设计)人: | 易建明;屈武斌;蔡万世;王瑞超;杭兴宜 | 申请(专利权)人: | 艾吉泰康生物科技(北京)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C40B40/06 |
代理公司: | 北京汇知杰知识产权代理有限公司 11587 | 代理人: | 蔡伦 |
地址: | 102206 北京市昌平区北京市中关*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 cas9 grna 系统 构建 扩增 文库 方法 | ||
1.一种利用Cas9/gRNA系统构建扩增子的方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
S1:采用多重PCR引物对多个目标区域进行扩增,得到多个扩增子,采用磁珠对所述扩增子进行纯化,所述多重PCR引物的3’端为特异性序列,能够与模板互补配对;所述多重PCR引物的5’端为通用序列,所述多重PCR引物5’端通用序列的长度在24nt以上,且通用序列3’端存在NGG的碱基排列,通用序列能够被Cas9/gRNA系统中的gRNA互补配对,使用多种不同的通用序列;
S2:采用Cas9蛋白酶,并加入与多重PCR引物5’端通用序列互补配对的gRNA,对扩增子和引物二聚体进行消化处理,特异性切割掉扩增子和引物二聚体两侧的通用序列,去除引物二聚体,采用磁珠对所述扩增子进行纯化,gRNA的5’端与所述多重PCR引物的5’端的通用序列互补配对;gRNA加入到反应体系中的种类与多重PCR引物使用的通用序列种类一致;
S3:依次对所述扩增子进行5’端磷酸化修饰,对扩增子的3’端添加“A”,然后用连接酶将测序接头连接到扩增子的5’端和3’端;
S4:将所述连接后的扩增子磁珠纯化后,得到扩增子文库,然后进行二代测序。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述Cas9蛋白酶为切割双链、切割单链或识别不同PAM结构的Cas9蛋白酶的变体。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,在所述步骤S2中,gRNA来自化学合成。
4.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,在所述步骤S2中,gRNA来自体外转录。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,使用T7DNA聚合酶转录 gRNA,gRNA的5’端添加GG序列。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,使用T4DNA聚合酶进行转录,在gRNA的5’端添加X碱基,增加T4DNA聚合酶的识别和转录。
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