[发明专利]一种体外评估胎儿颈部透明带增厚发生的阵列芯片

说明书

本发明提供了一种体外评估胎儿颈部透明带增厚发生的SNP阵列芯片，所述芯片含有针对位于人体染色体2号、4号、5号、7号、8号、10号、13号和17号染色体上，19个SNP位点的19条探针序列；本发明进一步提供了一种体外评估胎儿颈部透明带增厚发生的检测试剂盒，所述试剂盒由所述SNP阵列芯片和相关基因引物对组成；本发明所提供的阵列芯片和检测试剂盒可以对胎儿颈部透明带增厚的发生提供早期的评估，检测过程快速，高通量，且准确性高，适合工业产业化。

技术领域

本发明属于生命科学和生物技术领域，具体涉及一种体外评估胎儿颈部透明带增厚的SNP阵列芯片以及试剂盒。

技术背景

胎儿发育异常最为围产期所发生的一系列可导致严重出生缺陷的疾病之一，尽早的发现是及时阻止出生缺陷发生的重要因素。颈部透明带(nuchal translucecy，NT)是指胎儿颈后皮下组织内液体积聚的厚度，14周前部分正常胚胎上肢淋巴可出现短暂的回流障碍，出现暂时的透明层增厚。到14周左右时，胚胎的左右淋巴管与颈静脉窦相通以后，则透明层逐渐变薄消失，颈部透明带增厚与多种胎儿先天性异常(如唐氏综合征)都有较密切的关系，如染色体异常、心血管系统异常等。因此作为一项有效的检测指标，测量颈部透明带厚度已被较广泛地应用于胎儿染色体异常的筛查。

建立针对胎儿发育异常早期预测与评估的体系，一直人们长期追求的目标，对制定针对患有发育异常的胎儿采取何种阻止手段有重要指导意义。

大多数将妊娠10～14周胎儿颈部透明带厚度≥3.0mm作为NT增厚的临床筛查范围，根据胎儿多普勒超声影像学筛查很难对胎儿发育异常做出准确判断，多普勒超声检测胎儿颈部透明带厚度的缺点：由于多普勒超声检测方法需要操作人员的经验对NT厚度进行判断，因此人为判断为主要因素。而随这胎儿发育颈部透明带将发生变化，是否可以获得准确的孕周也将影响NT厚度的诊断结果。因此多普勒超声检测这种方法存在较高的假阳性率。

染色体核型分析技术需要对采集到的染色体标本进行培养，才能获得足够的样本量，经胰蛋白酶消化、Giemsa染色后在显微镜下按照一定的规定，人为的对其进行配对、编号和分组，并进行形态进行分析。

染色体核型分析技术的缺点：由于需要对染色体标本进行72小时培养，因此样本培养的效果直接决定后续检测的结果。另外整个检测过程均是按照一定的规定人为进行判断，因此实验人员的人为因素将影响检测结果。

因此人们对是否利于分子生物学的手段来对胎儿发育异常进行早期预测与评估给予很高期望，在基因突变预测与评估方面做出了诸多努力。尽管国内外研究众多，至今仍然缺乏能够早期准确识别胎儿发育异常的方法。

在分子生物学与分子标志物检测快速发展的今天，人们对胎儿发育异常有了更加深刻的认识。国外市场上已出现了人类全基因组SNP基因芯片，检测得到的数据量很大，需要人工进行数据手机，并进行专门的数据软件分析，检测成本高。

因此是否能够在基因领域开发一种体外检测芯片，能够针对胎儿的发育异常，尤其是胎儿颈部透明带增厚的发生进行较早的评估，从而能够更早地为后期的诊断和治疗提供参考，成为了胎儿发育异常领域的技术难题。

发明内容

为了解决上述技术问题，本发明提供了一种体外评估胎儿颈部透明带增厚的阵列芯片，其中，所述阵列芯片含有针对人体染色体2号、4号、5号、7号、8号、10号、13号和17号染色体上，19个相关基因SNP位点的19条探针序列，所述探针序列SEQ ID No：1-19。

发明人前期进行了大规模的研究(数据尚未公布)，临床上使用4837个病例(含正常人群样本)的NT作为病例组，正常样本为对照组，即胎儿发育异常孕妇与高龄未患有胎儿发育异常孕妇的数据进行全基因组关联分析。