[发明专利]一种与大口黑鲈生长性状相关的SNP标记及其应用

说明书

本发明涉及一种SNP标记，尤其涉及一种与大口黑鲈生长性状相关的SNP标记及其应用，所述SNP标记为SEQ ID NO.2序列284bp处的碱基多态位点。本发明创造性地提供了一种与大口黑鲈的生长性状相关的SNP标记，SNP标记不同的基因型与大口黑鲈的生长性状的相关性已经得到证实，在此基础上，利用该SNP标记，可以进行大口黑鲈的筛选或检测，或大口黑鲈的人工养殖过程中易于驯食人工配合饲料的大口黑鲈或其亲本的筛选或检测，在大口黑鲈的养殖或选育领域，都具有积极的效果，及在此基础上，开发了一系列的引物对、方法及相应试剂盒，具有很大的科学价值和商业价值。

技术领域

本发明涉及一种SNP标记，尤其涉及一种与大口黑鲈生长性状相关从而进一步与易于驯食人工配合饲料相关的SNP标记及其应用。

背景技术

大口黑鲈(Micropterus salmoides)，俗称加州鲈，是一种原产于北美的广温性肉食性鱼类，1983年引进到中国大陆，由于其具有生长快、肉质鲜美和易捕捞等特点，目前已成为我国主要淡水养殖品种之一。

但是，大口黑鲈作为肉食性鱼类，在养殖过程中需要利用冰鲜鱼或活鱼作为饲料的主要蛋白源，而这些冰鲜鱼或活鱼只能依靠海洋捕捞加工，这使得近几年鱼粉价格快速上升，并且供不应求。

目前，在大口黑鲈养殖领域，研究人员一直致力于开发与大口黑鲈成份相似的人工配合饲料。但是，由于大口黑鲈为肉食性鱼类，以食冰鲜鱼和活鱼为主，并不能很好的适应目前所开发的人工配合饲料，所以，投喂人工配合饲料的大口黑鲈会出现生长缓慢的现象，这一现象严重制约大口黑鲈养殖业的发展。

对大口黑鲈的人工配合饲料投喂进行研究发现，在投喂饲料的养殖过程中，从鱼苗开始，大口黑鲈存在着食性转化的过程，通常过程如下：鱼苗开口第1个星期，每天喂4次熟蛋黄，逐日有所增加；1星期后加喂剑水蚤；10天后又加入少量水蚯蚓，减少剑水蚤；20天后当鱼苗平均全长2.5厘米时，在水蚯蚓团中混入少量鲜鱼浆，以后逐日增加鲜鱼浆比例，直至全部便用鱼浆为止；大约需10天左右，开始投喂颗粒大小适口的人工配合饲料。在这过程中，由于大口黑鲈有同类相食的特点，在投喂人工配合饲料初期，快速的生长对于大口黑鲈的存活及养殖产量具有至关重要的意义。

为了解决上述问题，可以对大口黑鲈进行食性改良，通过选择育种，培育出对人工配合饲料具有良好消化能力和食欲的快长鱼类新品系。

在开展常规选育研究的同时，开发和应用分子标记辅助育种技术可使亲鱼的遗传选择更加准确有效，加快大口黑鲈良种的进一步选育。

SNP是单核苷酸多态的简称，是指在生物体的基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。单个核苷酸的变化可能会影响基因所编码蛋白氨基酸的变化或基因表达调节蛋白的结构域和结合能力的变化，进而影响蛋白结构、功能和蛋白合成量的变化，最终引起生物体表型的变化。这些SNP位点的基因型有可能与生物体的表型相关联。另外，SNP是可以从亲代遗传给子代的分子标记，可以通过选择含有目的性状相关的SNP标记的亲本，进行繁殖，以期获得含有这一性状的子代，以加快选育的进程。

发明内容

在本发明的第一方面，提供一种与大口黑鲈生长性状相关的SNP标记，所述SNP标记为SEQ ID NO.2序列284bp处的碱基多态位点。

应该理解，所述SNP标记也可以为SEQ ID NO.1序列106bp处的碱基多态位点。

应该理解，所述SNP标记也可以为SEQ ID NO.5序列61bp处的碱基多态位点。

进一步地，上述SNP标记的碱基为A/G碱基。

优选的，在SEQ ID NO.2序列的284bp处的碱基或SEQ ID NO.1序列的106bp处的碱基或SEQ ID NO.5序列的61bp处的碱基包含A的个体为目标个体，更进一步地，上述的碱基的只为AA的个体为目标个体。