[发明专利]一种基于高分辨率溶解曲线鉴定梨果肉高石细胞含量的SNP标记及其应用

说明书

本发明公开了一种基于高分辨率溶解曲线鉴定梨果肉高石细胞含量的SNP标记及其应用。一种与梨梨果肉石细胞含量的紧密相关的SNP标记Psc397‑15，引物：SEQ ID NO.1；SEQ ID NO.2。利用该特异引物基于高分辨率溶解曲线可对果肉高石细胞含量进行良好分型。本发明提供的梨果肉石细胞含量分子标记引物可用于梨果肉高石细胞含量的分子标记辅助选择育种，对于加快梨品种的遗传改良进程，提高育种选择效率具有重要的理论和实践指导意义。

技术领域

本发明属于分子遗传育种领域，涉及一种基于高分辨率溶解曲线鉴定梨果肉高石细胞含量的SNP标记及其应用。

背景技术

梨在我国栽培历史悠久，同时也是世界上重要的落叶果树。梨果实营养价值高,肉脆多汁，深受人们的喜爱。梨果实的食用品质一直是人们所关注的问题，它是决定梨果实经济价值的重要因素，因此提高梨的食用品质具有重要的意义。梨果实食用品质受众多因素的影响，其中石细胞是影响梨果实品质的重要因素之一。石细胞是梨果实中特有的一类厚壁细胞，它不仅影响梨果实的食用品质，而且影响其加工品质。降低梨果实石细胞的含量，对改善梨的品质至关重要。近年来，我国梨的主栽品种砀山酥梨由于品种退化或是管理不善的原因，石细胞含量增加，肉质变粗，口感多渣，严重影响了砀山酥梨的品质和经济价值。因此，优质低石细胞含量梨育种不仅成为二十一世纪国际梨育种的主要目标之一，也成为最近几年我国梨品种品质改良的热点和显著趋势。

梨新品种的选育主要以杂交选育为主，而杂交选育通常是通过表型进行的，多数控制梨果实经济性状的基因为数量性状(QTL)基因，并且梨的童期较长，利用传统的育种技术选育新的品种需要很长的时间，因此培育出品质优良、抗病、抗虫、丰产耐贮的综合性状优良的新品种具有很大困难。利用分子标记辅助选择(MAS)育种技术可以提高选择效率，加快育种步伐。SNP(single nucleotide polymorphism,单核苷酸多态性)分子标记作第三代分子标记的代表，具有变异丰富、高度稳定且易实现高通量自动化分析等特点，是传统的分子标记无可比拟的。近年来SNP分子标记受到了分子育种和系统进化研究领域的高度关注[1,2]，在群体遗传及系统发育分析[3]、遗传图谱构建[4]和物种多样性分析[5]等方面得到广发应用，成为作物研究领域的一项重要工具。

目前有关梨数量性状的QTL定位研究仍属起步阶段，已有的研究主要是针对一些病害或生长性状，对梨果肉高石细胞含量的SNP分子标记开发应用研究尚未有报道。因此，开展梨果肉高石细胞含量的SNP分子标记开发，并建立自然群体辅助选择技术体系，对于提高育种效率，节约生产成本显得尤为重要。

发明内容

本发明的目的是利用梨的重测序数据信息，开发基于高分辨率溶解曲线鉴定梨果肉高石细胞含量的SNP特异标记Psc397-15。通过该分子标记可以预测高果肉石细胞含量的梨品种，为实现梨果肉石细胞含量早期鉴定和筛选提供分子标记辅助育种的技术支持。

与梨果肉高石细胞含量紧密相关的SNP标记Psc397-15，其特征在于位于登录号为AJSU00000000的梨基因组序列Chr5的第26607684个碱基处；该标记在低石细胞含量品种中为A，高石细胞含量品种中为G。

本发明所述的SNP标记Psc397-15在鉴定梨果肉高石细胞含量中的应用。

本发明所述的SNP标记Psc397-15在梨果肉石细胞含量早期鉴定和筛选的分子育种中的应用。

与梨果肉高石细胞含量紧密相关的SNP标记引物对，由Psc397-15-F：SEQ ID NO.1和 Psc397-15-R：SEQ ID NO.2组成。

本发明所述的SNP标记引物对在鉴定梨果肉高石细胞含量中的应用。

本发明所述的SNP标记引物对在改善梨果肉石细胞含量的分子育种中的应用。