[发明专利]一种配对互作基因检测方法及预测模型

权利要求书

1.一种配对互作基因检测方法，其特征在于，包括以下步骤：

1)对给定的数据集{Y_i,X_ij}，首先对每个基因表达值进行秩规格化，得到规格化后的数据矩阵{Y_i,R_ij}；

2)对任意两个基因p和基因q采用abs模式进行转换，获得转换后的数据集{Y_i,Z_is}；abs模式:Z_is＝|R_ip–R_iq|；其中i＝1,2,…,n；p＝1,2,…,m；q＝1,2,…,m；p≠q；s＝1,2,…,m(m-1)/2；n为数据集中的样本数，m为数据集中的基因数；R_ip表示第i个样本的第p个基因排秩转换后的表达值；R_iq表示第i个样本的第q个基因排秩转换后的表达值；

3)基于t测验方法计算每个变量Z_is与表型Y_i之间的t值，根据t值对应的概率值p值判断两个基因之间的互作效应。

2.根据权利要求2所述的配对互作基因检测方法，其特征在于，对应p值小于0.05表示某一对基因互作达到显著水平。

3.根据权利要求2所述的配对互作基因检测方法，其特征在于，p值小于0.01表示某一对基因互作达到极显著水平。

4.一种配对互作基因预测模型，其特征在于，包括分类器，且该分类器的输入量为经abs模式转换后得到的第i个样本的第p个基因排秩转换后的表达值R_ip和第i个样本的第q个基因排秩转换后的表达值R_iq；其中，abs模式：Z_is＝|R_ip–R_iq|；其中i＝1,2,…,n；p＝1,2,…,m；q＝1,2,…,m；p≠q；s＝1,2,…,m(m-1)/2；n为数据集中的样本数，m为数据集中的基因数；R_ip表示第i个样本的第p个基因排秩转换后的表达值；R_iq表示第i个样本的第q个基因排秩转换后的表达值。

5.根据权利要求4所述的配对互作基因预测模型，其特征在于，所述分类器为SVC分类器。