[发明专利]一种可视化基因芯片检测肺部感染病原菌的方法在审
申请号: | 201710517219.2 | 申请日: | 2017-06-29 |
公开(公告)号: | CN107164526A | 公开(公告)日: | 2017-09-15 |
发明(设计)人: | 孙振学;杨长春;陈金宏;杨贵荣;张旭;邹德勇;段媛媛;高敏;赵海滨 | 申请(专利权)人: | 中国人民武装警察部队总医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 北京纽乐康知识产权代理事务所(普通合伙)11210 | 代理人: | 田磊 |
地址: | 100039 北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 可视化 基因芯片 检测 肺部 感染 病原菌 方法 | ||
1.一种可视化基因芯片检测肺部感染病原菌的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1基于临床的肺部感染病原菌谱确定;
S2根据细菌的特定基因做检测靶点;
S3设计通用引物和探针;
S4芯片制备;
S5靶基因扩增;
S6芯片杂交、洗涤;
S7基因芯片可视化检测;
S8优化条件,建立方法;
S9临床验证;
S10与细菌培养进行比对;和
S11建立肺部感染病原菌可视化基因芯片检测。
2.根据权利要求1所述的可视化基因芯片检测肺部感染病原菌的方法,其特征在于,步骤S2和S3中,以取筛查的10种细菌为检测靶点,采用计算机Clustal×1.8 msw Alignment软件对多种细菌的靶基因进行序列比对,采用Primer 5.0软件设计特异性引物与探针,并进行Blast分析筛选,筛选通用性引物和多种呼吸道致病菌特异性检测探针,所有下游引物在5′端进行生物素标记,全部寡核苷酸探针在3′端进行氨基修饰。
3.根据权利要求1所述的可视化基因芯片检测肺部感染病原菌的方法,其特征在于,步骤S4中,成引物、探针,将探针用点样液稀释至终浓度后,各取20ul置于384孔板,用点样仪将探针点到空白的醛基化修饰玻片上,于室温放置至少18h,每张芯片10个区,每个区为7×7 探针矩阵。
4.根据权利要求1所述的可视化基因芯片检测肺部感染病原菌的方法,其特征在于,步骤S7中,依次点加链霉亲和素标记的辣根过氧化物酶、生物素-标记的酪胺和链霉亲和素-纳米金孵育,最后加入银增强试剂显色,观测结果。
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