[发明专利]一株新型大肠杆菌H8噬菌体ST0的分离鉴定

说明书

本发明涉及用于去除病原性大肠杆菌的噬菌体ST0，属于生物工程领域。提供了一株新型烈性大肠杆菌噬菌体ST0(基因序列SEQ ID NO.1，GenBank Access no.MF044457)，有二十面体的头部和长尾，头部长约120nm，头部直径约80nm，尾部长约120nm，尾部直径约20nm。其DNA为环状双链结构，基因组长170,496bp，在155,681bp和156,511bp之间预测有10个tRNA，预测有269个开放阅读框，其中有89个有相似的蛋白功能。该噬菌体可作为一种生物防控手段，用于污水处理系统及医疗等领域病原菌的去除。

技术领域

本发明涉及用于大肠杆菌H8的防控，属于生物工程领域。特别地，本发明涉及对从污水处理系统中的一株新型噬菌体ST0(基因序列SEQ ID NO.1，GenBank Accessno.MF044457) 的分离及基因组基本性质分析，尤其是其功能基因和蛋白的预测分析。

背景技术

随着抗生素在医疗和农业等领域的广泛应用，耐药性菌株早已得到重视。环境中的抗生素不易生物降解，容易在水环境和土壤环境，甚至在大气环境中，储存和积累。近来，抗生素已被公认为新兴的环境污染物，因抗生素潜在的不良影响，对生态系统和人类健康。耐药性细菌也增加了医疗困难，在美国每年有23000人的死亡与耐药性细菌有关。耐药性细菌和耐药基因在环境中的传播是一个重大的公共卫生问题。显然，严格控制抗生素的使用和发展替代药物迫在眉睫。

与抗生素相比，噬菌体治疗具有特异性高、副作用少、低剂量使用等优点，特别是采用噬菌体疗法治疗因耐药性细菌引起的疾病具有替代作用。噬菌体治疗主要有单一噬菌体治疗、多种噬菌体共同治疗，及噬菌体与抗生素联合治疗的方式。目前，使用噬菌体在畜禽养殖、水产养殖和食品工业等方面去除病原菌做了较多研究，且取得了较好的成果。然而噬菌体的种类和数量是限制噬菌体治疗进一步发展的一个重要因素，因此分离和鉴定噬菌体来丰富噬菌体种库是十分必要的。

发明内容

本发明的目的在于：为噬菌体治疗和病原菌的防控提供一种可选择的基础材料，以此来丰富噬菌体种库，并进一步发展一种新型的生物防治手段。

本发明的另一目的在于：通过对噬菌体ST0的形态鉴定和全基因组测序，进一步深入挖掘功能基因和蛋白，为噬菌体治疗和生物防治提供一种或多种对病原菌具有裂解作用的酶类等，以此扩大宿主谱，有利于噬菌体应用的广泛性和有效性。

1.本发明中从污水处理系统中分离的新型烈性噬菌体ST0，其宿主为大肠杆菌H8，该噬菌体在双层平板上能产生透亮、边缘清晰的噬菌斑，噬菌斑直径在1毫米；透射电镜显示噬菌体ST0有二十面体的头部和长尾，头部长约120nm，头部直径约80nm，尾部长约120nm，尾部直径约20nm。

2.根据权利要求1所述的该噬菌体ST0的全基因组大小为170,496bp，为环形双链结构， G+C％含量为37.67％，并有10个tRNA区域和269个开放阅读框，GenBank数据库的登录号为MF044457。

3.根据权利要求1所述的该噬菌体对大肠杆菌H8具有强裂解效用，为工业化生产噬菌体及用于污水排放和污水回用中大肠杆菌的防治提供了噬菌体来源。

本发明的主要优点在于：根据本发明中的噬菌体ST0在裂解大肠杆菌H8的实验中表现出快速高效的裂解效用，可用于污水处理系统中大肠杆菌的爆发性状况的防治以及耐药性大肠杆菌的去除。

附图说明

图1噬菌体ST0的双层平板噬菌斑形态

图2噬菌体ST0透射电镜形态

图3噬菌体ST0的基因组圈图

图4噬菌体ST0基因组系统进化树

具体实施方式