[发明专利]用于简单异尖线虫/派氏异尖线虫LAMP-LFD检测的引物和探针序列有效
申请号: | 201710542194.1 | 申请日: | 2017-07-05 |
公开(公告)号: | CN107245521B | 公开(公告)日: | 2020-11-03 |
发明(设计)人: | 陈炯;周前进 | 申请(专利权)人: | 宁波大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6844;C12N15/11 |
代理公司: | 宁波奥圣专利代理事务所(普通合伙) 33226 | 代理人: | 何仲 |
地址: | 315211 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 简单 线虫 派氏异尖 lamp lfd 检测 引物 探针 序列 | ||
本发明公开了用于简单异尖线虫/派氏异尖线虫的LAMP‑LFD检测的引物和探针序列,特点是包括三对LAMP的引物AniITS‑F3、EtaompA‑B3;AniITS‑FIP、AniITS‑BIP;AniITS‑LF、AniITS‑LB;和一条探针AniITS‑HP,核苷酸序列如SEQ NO1‑NO7所示,利用上述的引物和探针,通过LAMP反应体系扩增步骤,探针杂交LAMP反应产物步骤,使用LFD检测步骤实现简单异尖线虫/派氏异尖线虫的可视化检测,优点是检测速度快,完成整个检测仅需50min,省时省力,对仪器设备依赖性小,更加适用于基层机构和现场疫源地检测。
技术领域
本发明涉及一种检测异尖线虫的引物和探针序列,尤其是涉及一种用于简单异尖线虫/派氏异尖线虫LAMP-LFD检测的引物和探针序列。
背景技术
异尖线虫(
目前,异尖线虫物种主要通过传统的形态学观察来鉴定。然而,此方法检测周期较长,且需要专业人士进行操作。近年来,国内外有许多学者建立了基于PCR的分子鉴定手段:SSCP法,常规PCR,多重PCR,PCR-RFLP和核糖体DNA和线粒体DNA测序法。这些分子的方法都需要复杂的仪器设备和专业的技术人员。
Notomi报道的环介导的等温扩增(LAMP)可在等温条件下更加快速和便捷的完成检测,这项技术吸引了各个领域的关注。LAMP产物可通过琼脂糖凝胶电泳(AGE)显现的梯状条带,裸眼观察浊度计和核酸染色(SYBR Green I,钙黄绿素等)等方法检测。虽然基于荧光的实时监控也可方便直观的检测,但是实时荧光仪器的价格较高。横向流动试纸条(LFD)是一种新型的方法,它能够高效、准确的检测LAMP产物。利用生物素标记的LAMP产物与异硫氰酸荧光素(Fluoresceinisothiocyanate,FITC)标记的探针进行特异性杂交,杂交产物与LFD上的抗FITC的抗体结合,形成免疫复合物。当其通过LFD的检测线时会被生物素配体所捕获,结合在检测线;未被捕获的将通过检测线,结合在质控线上。这种方法最初应用于检测水生病原体,病毒和细菌方面,如今在兽医和植物病害的检测中也得到了一定的应用。目前,国内外还未见报道将该技术应用于简单异尖线虫/派氏异尖线虫的检测。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是提供一种检测速度快,检测成本低,检测灵敏度和准确性高的用于简单异尖线虫/派氏异尖线虫的LAMP-LFD检测的引物和探针序列。
本发明解决上述技术问题所采用的技术方案为:一种用于简单异尖线虫/派氏异尖线虫的LAMP-LFD检测的引物和探针序列,其根据简单异尖线虫/派氏异尖线虫(GenBank登录号:KU991876)的rDNA-ITS2区段设计LAMP的三对引物序列和一条探针序列,引物序列具体如下:
AniITS-F3:5’- GAATTGCAGACACATTGAGC -3’
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