[发明专利]肺炎致病菌快速识别基因芯片有效
申请号: | 201710547772.0 | 申请日: | 2017-07-06 |
公开(公告)号: | CN107287311B | 公开(公告)日: | 2020-07-28 |
发明(设计)人: | 陈良安;马秀清;王升启;刘琪琦;李春笋;梁志欣 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军总医院 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/14;C12Q1/10;C12Q1/04;C40B40/06;C40B50/18;C12R1/46;C12R1/445;C12R1/21;C12R1/35;C12R1/385;C12R1/22;C12R1/19;C12R1/01 |
代理公司: | 北京京万通知识产权代理有限公司 11440 | 代理人: | 齐晓静 |
地址: | 100853*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肺炎 致病菌 快速 识别 基因芯片 | ||
1.一种肺炎致病菌快速识别基因芯片,其中,所述肺炎致病菌包括肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、流感嗜血杆菌、肺炎支原体、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、粪肠球菌、屎肠球菌、肺炎克雷伯杆菌、大肠埃希菌、阴沟肠杆菌、嗜麦芽窄食单胞菌、洋葱伯克霍尔德菌、嗜肺军团菌、肺炎衣原体;
所述基因芯片上包括用于与待检样品进行杂交的探针;
所述探针包括第一探针;所述第一探针用于鉴定所述肺炎致病菌的特异基因,由此确定被测细菌的种;
其中,
用于鉴定所述肺炎链球菌的第一探针的序列为:CAAAGTAGTACCAAGTGCCATTGATTTTCTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述金黄色葡萄球菌的第一探针的序列为:CAAAGAACTGATAAATATGGACGTGGCTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述流感嗜血杆菌的第一探针的序列为:GAACGTGGTACACCAGAATACAACATCGCTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述肺炎支原体的第一探针的序列为:TGAGGTGAATGGGTTGTTGAATCCGTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述铜绿假单胞菌的第一探针的序列为:TTGTGCCTGCTCGACCCGCTGGACGGGGTCTACAACTACCTCGCCCAGTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述鲍曼不动杆菌的第一探针的序列为:TCGATCCACGTGCTAAAGTGATTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述粪肠球菌的第一探针的序列为:TTACATGGGCCAAATGGTGAAGATGGAACATTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述屎肠球菌的第一探针的序列为:TCCTTTTTCCGTCATCAGTATAAAGTATAGTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述肺炎克雷伯杆菌的第一探针的序列为:AAAGCCGGCGTGTACGATAATTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述大肠埃希菌的第一探针的序列为:CGCCAAATCCGCAACGTAATGACAGTGTACCAACCCTTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述阴沟肠杆菌的第一探针的序列为:GCAGGCGATCTGTACGTTCAGGTTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述嗜麦芽窄食单胞菌的第一探针的序列为:TACCACCCGTACCTGGACTTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述洋葱伯克霍尔德菌的第一探针的序列为:TGGTGCGCTCGGGCTCGATCGACATTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述嗜肺军团菌的第一探针的序列为:ATAGCATTGGTGCCGATTTGGGGAAGAATTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述肺炎衣原体中的第一探针的序列为:ACTGCCGTAGATAGACCTAACCCGGCCTATTTTTTTTTTTT;
所述探针包括第二探针;所述第二探针用于鉴定所述肺炎致病菌的16S rDNA基因,由其确定被测细菌的属;
其中,
用于鉴定所述肺炎链球菌的第二探针的序列为:TGTGAGAGTGGAAAGTTCACACTGTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述金黄色葡萄球菌的第二探针的序列为:ACATATGTGTAAGTAACTGTGCACATCTTGACGGTATTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述流感嗜血杆菌的第二探针的序列为:GAGGAAGGTTGATGTGTTATTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述肺炎支原体的第二探针的序列为:GACCTGCAAGGGTTCGTTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述铜绿假单胞菌的第二探针的序列为:TTGCTGTTTTGACGTTACTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述鲍曼不动杆菌的第二探针的序列为:CCTAGAGATAGTGGACGTTACTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述粪肠球菌的第二探针的序列为:AGTGCTTGCACTCAATTGGAAAGAGGAGTGGTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述屎肠球菌的第二探针的序列为:CAAGGATGAGAGTAACTGTTCATCCCTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述嗜麦芽窄食单胞菌的第二探针的序列为:CCAGCTGGTTAATACCCGGTTGGGATTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述洋葱伯克霍尔德菌的第二探针的序列为:TTGGCTCTAATACAGTCGGTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述嗜肺军团菌的第二探针的序列为:AGGGTTGATAGGTTAAGAGCTGATTAATTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述肺炎衣原体中的第二探针的序列为:CCGAATGTAGTGTAATTAGGCTTTTTTTTTTTT;
用于鉴定所述肺炎克雷伯杆菌、大肠埃希菌、阴沟肠杆菌的第二探针的序列为:GGTTAATAACCTCATCGATTGACGTTACCCTGCTTTTTTTTTTTT。
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