[发明专利]一种检测4种致病菌的四重实时荧光PCR方法有效
申请号: | 201710582031.6 | 申请日: | 2017-07-17 |
公开(公告)号: | CN107338294B | 公开(公告)日: | 2018-06-19 |
发明(设计)人: | 孙端方;李春宇;田志强;董睿;寻思颖;肖莉;陈梅 | 申请(专利权)人: | 贵州省产品质量监督检验院 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686;C12Q1/14;C12Q1/10;C12Q1/04 |
代理公司: | 贵阳中工知识产权代理事务所 52106 | 代理人: | 刘安宁 |
地址: | 55001*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 荧光PCR 致病菌 检测 种检测 扩增 探针 单核细胞增生李斯特菌 金黄色葡萄球菌 荧光PCR试剂盒 荧光PCR预混液 肠道沙门氏菌 副溶血性弧菌 基因设计引物 致病菌检测 标准误差 待测样品 多个目标 扩增条件 目标序列 试剂成本 试剂配方 通用引物 阳性对照 荧光信号 样品DNA 试剂盒 引物 化妆品 基因 激发 节约 | ||
1.一种检测4种致病菌的四重荧光PCR方法,具有四重荧光PCR技术的4个要素,即:样品DNA、一对通用引物和四条探针、荧光PCR预混液、阳性对照;其特征在于:根据4种致病菌的16S rRNA基因设计引物和探针,对目标序列进行扩增并激发相应的荧光信号,对非目标序列无扩增和荧光信号;将待测样品DNA进行荧光PCR扩增的试剂配方和扩增条件制成试剂盒;所述4种致病菌是:金黄色葡萄球菌,学名Staphylococcus aureus,简称St.aureus;肠道沙门氏菌,学名Salmonella enterica,简称Sa.enterica;单核细胞增生李斯特菌,学名Listeria monocytogenes,简称L.monocytogenes;副溶血性弧菌,学名Vibrioparahemolyticus,简称V.parahemolyticus;所述样品为食品样品;
具体的做法包括:
第一步,建立检测St.aureus、Sa.enterica、L.monocytogenes、V.parahemolyticus的四重荧光PCR引物体系;
第二步,建立检测St.aureus、Sa.enterica、L.monocytogenes、V.parahemolyticus的四重荧光PCR试剂盒;
第三步,确定检测St.aureus、Sa.enterica、L.monocytogenes、V.parahemolyticus的四重荧光PCR鉴定方法,即以待测样品总DNA为模板,利用所述的四重荧光PCR引物体系,在可同时检测FAM、VIC、TARMA、Cy5激发荧光基团和MGB淬灭荧光基团的四通道及以上的荧光PCR仪上进行扩增和检测;
所述检测St.aureus、Sa.enterica、L.monocytogenes、V.parahemolyticus的四重荧光PCR引物体系:序列1为St.aureus、Sa.enterica、L.monocytogenes、V.parahemolyticus的通用上游引物,序列2为St.aureus、Sa.enterica、L.monocytogenes、V.parahemolyticus的通用下游引物,序列3为St.aureus特异性探针,序列4为Sa.enterica特异性探针,序列5为L.monocytogenes特异性探针,序列6为V.parahemolyticus特异性探针;序列3、4、5、6在5’端分别用FAM、VIC、TARMA、Cy5荧光激发基团修饰,3’端均为MGB荧光淬灭基团修饰。
2.按照权利要求1所述的四重荧光PCR方法,其特征在于所述检测St.aureus、Sa.enterica、L.monocytogenes、V.parahemolyticus的四重荧光PCR试剂盒成分如下所示:
①引物:包括序列1、2所示引物,浓度均为20μmol/L,使用1.5mL无色透明离心管封装;
②探针:包括序列3、4、5、6所示探针,浓度均为10μmol/L,使用1.5mL棕色不透明离心管封装;
③荧光PCR试剂:经验证可适用于所述的四重荧光PCR引物体系的外购的试剂套装,包括荧光PCR预混液、ROX染料、三蒸水;
④阳性对照:包括含有序列1和序列2所示引物扩增目的片段的St.aureus、Sa.enterica、L.monocytogenes、V.parahemolyticus源性DNA,浓度均为105拷贝/μL,使用1.5mL无色透明离心管封装;
⑤阴性对照:阴性对照为非St.aureus、Sa.enterica、L.monocytogenes、V.parahemolyticus源性DNA或三蒸水;
⑥空白对照:为三蒸水。
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