[发明专利]用于鉴定结球甘蓝开花早晚的分子标记、引物对及分子标记方法与应用

权利要求书

1.一种用于鉴定结球甘蓝开花早晚的InDel分子标记，命名为InDel-FLC2，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。

2.如权利要求1所述的分子标记，其特征在于：晚开花结球甘蓝的BoFLC2基因缺失所述分子标记，早开花结球甘蓝的BoFLC2基因含有所述分子标记。

3.如权利要求2所述的分子标记，其特征在于：晚开花结球甘蓝的BoFLC2基因编码区序列缺失所述分子标记，早开花结球甘蓝的BoFLC2基因编码区序列含有所述分子标记。

4.如权利要求3所述的分子标记，其特征在于：晚开花结球甘蓝的BoFLC2基因编码区序列第一个内含子区域缺失所述分子标记，早开花结球甘蓝的BoFLC2基因编码区序列第一个内含子区域含有所述分子标记。

5.扩增权利要求1所述分子标记的引物对，其特征在于：上游引物序列如SEQ ID NO.2所示，下游引物序列如SEQ ID NO.3所示。

6.权利要求1所述分子标记的获得方法，其特征在于包括以下步骤：

步骤（1）：锚定早开花和晚开花结球甘蓝的BoFLC2基因的差异区段；

步骤（2）：测序获得早开花和晚开花结球甘蓝的BoFLC2基因核苷酸序列，结合步骤（1）锚定的差异区段，比较获得差异的核苷酸序列信息；

步骤（3）：根据差异区段核苷酸序列信息，设计引物对，对结球甘蓝进行基因型分析；

步骤（4）：结合早开花、晚开花结球甘蓝的开花期表型数据和其基因型，获得分子标记。

7.如权利要求6所述的获得方法，其特征在于包括以下步骤：

步骤（1）：设计结球甘蓝BoFLC2基因上游的启动子区域引物对和BoFLC2基因编码区引物对，选取样本数大于10的早开花、晚开花结球甘蓝，分别进行PCR扩增，比较获得早开花、晚开花结球甘蓝的BoFLC2基因中具有统计学差异的区段；

步骤（2）：测序获得早开花和晚开花结球甘蓝的BoFLC2基因核苷酸序列，结合步骤（1）获得的具有统计学差异的区段，比较获得差异区段核苷酸序列信息；

步骤（3）：根据步骤（2）获得的差异区段核苷酸序列信息，设计引物对，对结球甘蓝进行基因型分析；

步骤（4）：结合早开花、晚开花结球甘蓝的开花期表型数据和基因型，鉴定获得分子标记，所述分子标记位于BoFLC2基因编码区第一个内含子区域，长度为215bp，晚开花结球甘蓝BoFLC2基因编码区第一个内含子区域缺失所述分子标记，早开花结球甘蓝BoFLC2基因编码区第一个内含子区域含有所述分子标记。