[发明专利]辣椒分子标记及其多态性在鉴定辣椒花粉育性中的应用

说明书

本发明公开了辣椒分子标记及其多态性在鉴定辣椒花粉育性中的应用。本发明的辣椒分子标记为以辣椒基因组DNA为模板，采用引物对PW6‑126进行PCR扩增得到的DNA分子；引物对PW6‑126由名称分别为PW6‑126F和PW6‑126R的单链DNA组成，PW6‑126F为辣椒基因组DNA中与序列表中序列3的第85位的上游特异结合的单链DNA，PW6‑126R为辣椒基因组DNA中与序列表中序列3的第108位的下游特异结合的单链DNA。实验证明，本发明中的辣椒分子标记与辣椒花粉育性相关，在育种实际应用中可以利用该标记对辣椒花粉育性进行快速鉴定。

技术领域

本发明涉及生物技术领域中，辣椒分子标记及其多态性在鉴定辣椒花粉育性中的应用。

背景技术

辣椒(Capsicum annuumL.)属于常异花授粉植物，具有明显的杂种优势。杂交辣椒品种已大量应用于生产。利用辣椒雄性不育性培育一代杂种，可以降低生产成本，显著提高一代杂种的种子纯度。根据调控机理的不同，辣椒雄性不育主要分为细胞核雄性不育型(Genic Male Sterility,GMS)、细胞质雄性不育型(Cytoplasmic Male Sterility,CMS)，其中细胞核雄性不育仅由核基因控制，而细胞质雄性不育是由细胞核基因与细胞质基因共同调控，相比于GMS，CMS可获得100％的不育株，可以通过三系配套实现杂种优势育种，拥有广泛的应用前景。辣椒雄性不育的利用是迄今为止降低辣椒制种成本的最有效途径之一。

辣椒CMS是由线粒体中的不育基因导致的不能产生正常功能花粉的现象，这种现象可以被细胞核中的恢复基因(restorer-of-fertility,Rf)抑制或消除。利用辣椒细胞质雄性不育实现三系配套育种的关键之一就是找到具有恢复基因Rf的恢复系材料。为此，国内外学者在Rf基因的定位及连锁标记开发方面做了大量研究。在Rf基因的定位方面，目前普遍将其作为单基因控制的质量性状来研究，目前已普遍认为，Rf基因位于辣椒的第6号染色体上。在连锁标记开发方面，国内外学者开发了许多与Rf基因连锁的分子标记，但在紧密连锁程度及适用性上还有待提高。

分子标记辅助育种作为当前育种工作的重要辅助手段，其关键就是开发出高效的分子标记。与目标性状紧密连锁并且稳定、检测方便快捷的分子标记直接对基因型进行选择,极大的提高育种中选择的准确性和效率，显著缩短育种周期。因此，开发高效的分子标记对于品种改良及新品种选育具有重要意义。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是如何鉴定辣椒花粉育性。

本发明首先提供了辣椒分子标记或其多态性在鉴定或辅助鉴定辣椒花粉育性中的应用；

所述辣椒分子标记为以辣椒基因组DNA为模板，采用引物对PW6-126进行PCR扩增得到的DNA分子；

所述引物对PW6-126由名称分别为PW6-126F和PW6-126R的单链DNA组成，所述PW6-126F为辣椒基因组DNA中与序列表中序列3的第85位的上游特异结合的单链DNA，所述PW6-126R为辣椒基因组DNA中与序列表中序列3的第108位的下游特异结合的单链DNA。

所述PW6-126F具体可为序列表中序列1所示的单链DNA，所述PW6-126R具体可为序列表中序列2所示的单链DNA。

本发明还提供了鉴定辣椒基因型的方法，所述基因型为RfRf基因型、Rfrf基因型和rfrf基因型；所述方法为下述O或P：

O、包括：检测待测辣椒基因组中对应于序列表中序列3的第85-108位的序列，如所述待测辣椒基因组中两条染色体均为下述g1)的染色体，所述待测辣椒为RfRf基因型辣椒；如所述待测辣椒基因组中两条染色体均为下述g2)的染色体，所述待测辣椒为rfrf基因型辣椒；如所述待测辣椒基因组中两条染色体一条为下述g1)的染色体、另一条为下述g2)的染色体，所述待测辣椒为Rfrf基因型辣椒；