[发明专利]肺癌和肺部结节蛋白特征谱及其构建方法与应用有效
申请号: | 201710624070.8 | 申请日: | 2017-07-27 |
公开(公告)号: | CN107449916B | 公开(公告)日: | 2019-05-21 |
发明(设计)人: | 陈宁;李燕;尚卓婷;白晓婷;徐敏;伊娜;林正宇 | 申请(专利权)人: | 北京邦菲生物科技有限公司 |
主分类号: | G01N33/68 | 分类号: | G01N33/68;G01N33/574 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;张立娜 |
地址: | 102206 北京市昌平区中关村生*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肺癌 肺部 结节 蛋白 特征 及其 构建 方法 应用 | ||
本发明公开了一种肺癌和肺部结节蛋白特征谱及其构建方法与应用。该方法包括:分别从肺癌/肺部结节患者组和健康对照者组的血浆中提取总蛋白,胰蛋白酶酶解,iTRAQ标记,二维液相色谱和串联质谱检测,相对定量分析,获得肺癌/肺部结节相关蛋白特征谱;肺癌相关蛋白特征谱中,肺癌患者组和健康对照者组中表达差异的蛋白为上调蛋白(SAA1、SERPINA1、CRP、IGHG4和CFH);肺部结节相关蛋白特征谱中,肺部结节患者组和健康对照者组中表达差异的蛋白为上调蛋白(SERPINA1和CRP)和下调蛋白(SAA1、IGHG4和CFH)。本发明有助于研究肺癌和肺部结节生物学本质,对肺癌和肺部结节规范分型有重要意义。
技术领域
本发明属于医学和蛋白质组学领域,涉及一种肺癌和肺部结节蛋白特征谱及其构建方法与应用。
背景技术
肺癌是发病率和死亡率增长最快,对人群健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一。近50年来许多国家都报道肺癌的发病率和死亡率均明显增高,男性肺癌发病率和死亡率均占所有恶性肿瘤的第一位,女性发病率占第二位,死亡率占第二位。肺部结节是一种病因未明的肺部肉芽肿性疾病,近来已引起国内广泛注意。
目前,肺癌的诊断方法有X线检查、支气管镜检查、细胞学检查、剖胸探查术、ECT检查、纵隔镜检查等。然而这些检查存在着各种弊端,或费时费力、或会给病人带来极大痛苦。
蛋白质组学是在1994年由Williams和Wilkins提出的,通过寻找特异性蛋白质,为研究疾病机制提供线索。近年来随着人类蛋白质组学计划的全面启动,蛋白质组学的研究也产生了巨大进展,蛋白质组学研究中应用的定量方法主要有两种,一种是基于传统双向凝胶电泳及染色基础上的定量,另外一种是基于质谱检测技术的定量,包括标记定量技术(iTRAQ)和非标记定量技术(Label free quantification)两种。iTRAQ结合二维凝胶色谱与串联质谱是将iTRAQ同位素标记技术、二维液相色谱技术、串联质谱技术相联用,能对所有蛋白质进行同位素标记,与质谱联用时,信号离子表现为不同质荷比的峰,根据波峰的高度及面积可得到准确的蛋白质定量信息,适合对多样本的平行分析,可用于发现更多与疾病相关的蛋白质。
SAA1:血清淀粉样蛋白A(serum amyloid A,SAA)是一种急性时限反应蛋白,属于载脂蛋白家族中的异质类蛋白质,相对分子量约12000。在急性时限反应中,经IL-1、IL-6和TNF刺激,SAA在肝脏中由被激活的巨噬细胞和纤维母细胞合成,可升高到最初浓度的100-1000倍,但半衰期极短,只有50分钟左右。血清淀粉样蛋白A与高密度脂蛋白(HDL)有关,它能在炎症期间调节高密度脂蛋白的代谢。血清淀粉样蛋白A一个特别重要的特性是其降解产物能以淀粉样蛋白A(AA)原纤维的方式沉积在不同的器官中,在慢性炎症疾病中这是一种严重的并发症。
SERPINA1:α-1抗胰蛋白酶(Alpha-1-antitrypsin,SERPINA1)是一种糖蛋白。含糖10%~20%,主要由肝脏合成,广泛分布于正常人血清和体液中。它是血清中最主要的蛋白酶抑制剂,对凝血酶、尿激酶等其他酶也有抑制作用;也是一种急性时相反应蛋白,在炎症性疾患时,α-1抗胰蛋白酶可透过毛细血管进入组织液,在炎症局部往往浓度很高,对急性炎性疾病有一定限制作用。
CRP:人类C反应蛋白(C-reactive protein,CRP)是指在机体受到感染或组织损伤时血浆中一些急剧上升的蛋白质(急性蛋白)。CRP可以激活补体和加强吞噬细胞的吞噬而起调理作用,从而清除入侵机体的病原微生物和损伤,坏死,凋亡的组织细胞,在机体的天然免疫过程中发挥重要的保护作用。CRP在健康人血清中浓度很低(<5mg/L),而在细菌感染或组织损伤时,其浓度显著升高,故被认为其最有价值。
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