[发明专利]一种长久高效保存大熊猫粪便中DNA的方法在审

专利信息
申请号: 201710625579.4 申请日: 2017-07-27
公开(公告)号: CN107177590A 公开(公告)日: 2017-09-19
发明(设计)人: 张和民;李德生;黄炎 申请(专利权)人: 中国大熊猫保护研究中心;四川省自然资源科学研究院
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12Q1/68
代理公司: 成都金英专利代理事务所(普通合伙)51218 代理人: 袁英
地址: 611844 四川省成*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 一种 长久 高效 保存 大熊猫 粪便 dna 方法
【权利要求书】:

1.一种长久高效保存大熊猫粪便中DNA的方法,其特征在于,包括以下步骤:

a、样品采集:采集排便时间<12h的大熊猫粪便;

b、样品预处理:将a步骤采集的大熊猫粪便的表层去除,浸没在无水乙醇中22~26h;

c、样品保存:取出b步骤浸泡后的粪便样品,干燥,转入底部铺满硅胶珠的离心管中,排尽瓶中空气。

2.根据权利要求1所述一种长久高效保存大熊猫粪便中DNA的方法,其特征在于,b步骤中采用无菌镊子将a步骤采集的大熊猫粪便的表层去除,浸没在无水乙醇中24h。

3.根据权利要求1所述一种长久高效保存大熊猫粪便中DNA的方法,其特征在于,c步骤中所述干燥温度为60~70℃,干燥时间为1.5~2.5h。

4.根据权利要求3所述一种长久高效保存大熊猫粪便中DNA的方法,其特征在于,c步骤中所述干燥温度为65℃,干燥时间为2h。

5.根据权利要求1所述一种长久高效保存大熊猫粪便中DNA的方法,其特征在于,c步骤中采用脱脂棉排尽瓶中空气。

6.根据权利要求1所述一种长久高效保存大熊猫粪便中DNA的方法,其特征在于,所述样品保存之后还包括DNA提取及检测步骤。

7.根据权利要求6所述一种长久高效保存大熊猫粪便中DNA的方法,其特征在于,所述DNA提取及检测步骤具体包括以下步骤:

Ⅰ、DNA提取:样品分别保存6个月、12个月、24个月后,用酚-氯仿抽提法提取大熊猫粪便的DNA;

Ⅱ、引物合成:采用PAGE纯化法合成引物,引物的上游序列为

ptp:5’CTCCCTAAGACTCAAGGAAG3’;

下游序列为p12s:5’TAGGAAGGCTAGGACCAAACC3’;

Ⅲ、PCR扩增:将步骤Ⅰ提取的DNA样品用合成的引物进行扩增;

Ⅳ、PCR扩增体系:1μL含Mg2+的10xBuffer,0.8μL 2.5mM的dNTP,0.4μL 10mM的上游引物,0.4μL 10mM的下游引物,0.1μL BSA, 0.1μL 5U/μL的rTaq酶,1μL基因组DNA,6.2μL灭菌超纯水;

Ⅴ、PCR扩增条件:95℃总变性5分钟,95℃变性30秒,55℃退火30秒,72℃延伸1分30秒,共35个循环;最后72℃总延伸5分钟;

Ⅵ、扩增结果检测:扩增产物用1.5%的琼脂糖进行电泳检测;统计扩增成功样品,计算扩增成功率。

8.根据权利要求7所述一种长久高效保存大熊猫粪便中DNA的方法,其特征在于,Ⅳ步骤中所述基因组DNA采用无菌超纯水、按照体积比1:10进行稀释。

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