[发明专利]一种与苏淮猪肉色性状相关的SNP标记及其引物和应用有效
| 申请号： | 201710645868.0 | 申请日： | 2017-08-01 |
| 公开（公告）号： | CN107937552B | 公开（公告）日： | 2020-01-21 |
| 发明（设计）人： | 黄瑞华;张倩;李平华;汪涵;王彬彬;兰亭旭;牛培培;张总平 | 申请（专利权）人： | 南京农业大学;南京农业大学淮安研究院 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 32218 南京天华专利代理有限责任公司 | 代理人： | 傅婷婷;徐冬涛 |
| 地址： | 211225 江苏省南京市溧*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 猪肉 性状 相关 snp 标记 及其 引物 应用 | ||
1.一种基于与苏淮猪肉色红度值相关的SNP标记开发分子标记的方法，其特征在于以含有与苏淮猪肉色红度值相关的SNP标记的核苷酸序列为基础序列，设计引物对，以苏淮猪基因组DNA为模板进行PCR扩增，使所述的与苏淮猪肉色红度值相关的SNP标记转化为分子标记; 所述SNP标记位于猪12号染色体上的核苷酸序列上，所述SNP标记的位点为国际猪基因组10.2版本参考序列猪12号染色体上g.45318896核苷酸位点，且具有G/A多态性，所述SNP标记与苏淮猪的肉色红度值极显著相关；所述的引物对序列为上游引物：SEQ ID NO：2，下游引物：SEQ ID NO：3，所述的分子标记序列如SEQ ID NO：1所示，所述的SNP位点位于第221位，存在G/A多态性。
2.按照权利要求1所述的方法得到的分子标记；其特征在于所述的分子标记序列如SEQID NO：1所示，所述的SNP位点位于第221位，存在G/A多态性。
3.一种用于检测权利要求1中所述的与苏淮猪肉色红度值相关的SNP标记的引物对，其特征在于上游引物为：SEQ ID NO：2，下游引物为：SEQ ID NO：3。
4.一种检测权利要求1中所述的与苏淮猪肉色红度值相关的SNP标记的方法，其特征在于包括以下步骤：
（1）取苏淮猪的耳组织样品并提取总DNA；
（2）用已提取的苏淮猪基因组DNA为模板，使用上游引物为：SEQ ID NO：2和下游引物为：SEQ ID NO：3进行PCR扩增；
（3）扩增产物进行测序，分析测序结果，判读在SEQ ID NO：1第221位的G/A多态性。
5.与苏淮猪肉色红度值相关的SNP标记在筛选肉色红度值高的苏淮猪品系中的应用，所述SNP标记位于猪12号染色体上的核苷酸序列上，所述SNP标记的位点为国际猪基因组10.2版本参考序列猪12号染色体上g.45318896核苷酸位点，且具有G/A多态性，所述SNP标记与苏淮猪的肉色红度值极显著相关。
6.权利要求2所述的分子标记在筛选肉色红度值高的苏淮猪品系中的应用。
7.权利要求3所述的引物对在筛选肉色红度值高的苏淮猪品系中的应用。
8.一种筛选肉色红度值高的苏淮猪品系的方法，其特征在于包括检测苏淮猪国际猪基因组10.2版本参考序列猪12号染色体上g.45318896核苷酸位点的基因型，选育g.45318896核苷酸位点的AA型和GA型个体作为种猪。
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