[发明专利]一种组蛋白免疫共沉淀(ChIP)试剂配方在审
申请号: | 201710660025.8 | 申请日: | 2017-08-04 |
公开(公告)号: | CN109387623A | 公开(公告)日: | 2019-02-26 |
发明(设计)人: | 李旦 | 申请(专利权)人: | 苏州同因生物科技有限公司 |
主分类号: | G01N33/531 | 分类号: | G01N33/531;G01N33/543 |
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地址: | 215500 江苏省苏州市常熟高新技*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 组蛋白 免疫共沉淀 试剂配方 实例研究 基因型 配方 检测 保证 | ||
1.一种组蛋白免疫共沉淀(ChIP)试剂配方,其特征在于,包含以下内容:
(1)进行蛋白-DNA交联和裂解细胞:用终浓度为1%甲醛溶液固定总数为1×107的K562细胞,室温下放置10min,甘氨酸溶液中止反应;用预冷的PBS洗涤细胞两次,离心去上清后加入1ml含蛋白酶抑制剂的SDS裂解液裂解细胞;
(2)超声断裂染色质:按优化好的条件(100W,每次超声10s,共5次,间隔30s)断裂细胞裂解液中的染色质,4℃下离心后保留上清;
(3)免疫共沉淀:超声处理后的溶液中加入蛋白G-琼脂糖小珠进行预清除,离心后吸取1%(v/v)上清留作Input溶液在剩余的上清中加入免疫共沉淀抗体,包括阳性对照抗体(anti-RNA Polymerase II,1.0μg/管)、阴性对照抗体(normal mouse Ig G,1.0μg/管)和目的抗体(依抗体说明书推荐量:抗ac H3抗体10μg/管,抗ac H4抗体3μg/管),在4℃摇床上孵育过夜,次日溶液中加入蛋白G-琼脂糖小珠吸附免疫沉淀复合物,短暂离心后去上清,顺次用低盐、高盐、氯化锂和TE缓冲液清洗蛋白G-琼脂糖小珠;
(4)免疫沉淀复合物洗脱:用洗脱缓冲液洗脱免疫沉淀复合物,同时在装有Input溶液的管中加入相同体积的洗脱缓冲液;
(5)蛋白-DNA结合物解交联,释放DNA:加入5mol/L Na Cl溶液,65℃水浴孵育4-5h或过夜;
(6)用DNA纯化柱回收DNA。
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