[发明专利]应用二代测序技术分析牙髓干细胞与根尖牙乳头干细胞差异miRNAs表达谱的方法在审
申请号: | 201710696934.7 | 申请日: | 2017-08-15 |
公开(公告)号: | CN107267655A | 公开(公告)日: | 2017-10-20 |
发明(设计)人: | 吕红兵;林诗晗;胡雪刚;邱在玲 | 申请(专利权)人: | 福建医科大学附属口腔医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 福州市鼓楼区京华专利事务所(普通合伙)35212 | 代理人: | 林晓琴 |
地址: | 350000 福建*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 应用 二代 技术 分析 牙髓 干细胞 根尖 乳头 差异 mirnas 表达 方法 | ||
1.一种应用二代测序技术分析牙髓干细胞与根尖牙乳头干细胞差异miRNAs表达谱的方法,其特征在于:包括如下操作步骤:
(1)培养牙髓干细胞和根尖牙乳头干细胞:选取新鲜拔除的第三磨牙,在无菌条件下取出牙髓、根尖牙乳头组织,将组织剪碎,并采用I型胶原酶及dispase酶于37℃下消化30min,之后离心重悬,用细胞筛过滤重悬液,获得单细胞悬液;
(2)牙髓干细胞和根尖牙乳头干细胞的分选:对步骤(1)中获得的单细胞悬液,利用胰酶消化收集其中对数生长期的细胞,并依据抗体说明书采用鼠抗人STRO-1-PE标记细胞,经免疫磁珠分选收集STRO-1阳性细胞,所收集到的STRO-1阳性细胞即为所需的牙髓干细胞和根尖牙乳头干细胞;
(3)二代测序技术检测细胞miRNAs表达谱:分别取步骤(2)经分选后的牙髓干细胞和根尖牙乳头干细胞,加入Trizol混合后抽提总RNA;使用TruSeq Small RNA Sample Prep Kit,按照厂家的标准流程,主要步骤如下:测定RNA的浓度、琼脂糖凝胶电泳检查RNA的完整性、以及测定RNA的RIN值,完成RNA样本质检后,使用接头对切胶回收的20-40nt的miRNAs的3’与5’端进行连接,逆转录合成cDNA第一链,随后进行PCR扩增,PCR扩增产物经PAGE电泳质检、切胶纯化、浓度测定以及质检后,将浓度统一调整为2nM,miRNAs文库构建即告完成;待测miRNAs文库在cBot上完成簇类生长,然后将流通池转移到基因测序系统上,按照标准流程进行二代测序及数据分析。
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