[发明专利]一种用于检测CYP2C9和VKORC1基因多态性的组合物及其应用在审
申请号: | 201710697831.2 | 申请日: | 2017-08-15 |
公开(公告)号: | CN107287340A | 公开(公告)日: | 2017-10-24 |
发明(设计)人: | 刘沛;王林海 | 申请(专利权)人: | 北京鑫诺美迪基因检测技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京同辉知识产权代理事务所(普通合伙)11357 | 代理人: | 孙艳敏,杨敬 |
地址: | 100176 北京市大兴区经济技*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 cyp2c9 vkorc1 基因 多态性 组合 及其 应用 | ||
1.一种用于检测CYP2C9和VKORC1基因多态性的组合物,其特征在于,所述组合物包括针对用于检测待检样品中分别与CYP2C9和VKORC1基因相关的特异性目的基因的引物对和探针,包括:
CYP2C9*2引物:
CYP2C9*2基因正向引物(CYP2C9*2-F):SEQ ID NO.1;
CYP2C9*2基因反向引物(CYP2C9*2-R):SEQ ID NO.2;
探针CYP2C9*2-CFP:SEQ ID NO.3;
探针CYP2C9*2-TFP:SEQ ID NO.4;
CYP2C9*3引物对:
CYP2C9*3基因正向引物(CYP2C9*3-F):SEQ ID NO.5;
CYP2C9*3基因反向引物(CYP2C9*3-R):SEQ ID NO.6;
探针CYP2C9*3-AF:SEQ ID NO.7;
探针CYP2C9*3-CFP:SEQ ID NO.8;
VKORC1引物对:
VKORC1基因正向引物(VKORC1-F):SEQ ID NO.9;
VKORC1基因反向引物(VKORC1-R):SEQ ID NO.10;
探针VKORC1-GFP:SEQ ID NO.11;
探针VKORC1-AFP:SEQ ID NO.12;
内标引物对:
HER2-F:SEQ ID NO.13;
HER2-R:SEQ ID NO.14;
探针HER2-FP:SEQ ID NO.15;
其中对CYP2C9*2-CFP、CYP2C9*3-AF和VKORC1-GFP的5’端进行FAM修饰,3’端进行BHQ1修饰;对CYP2C9*2-TFP、CYP2C9*3-CFP和VKORC1-AFP的5’端进行ROX修饰,3’端进行BHQ2修饰;对HER2-FP的5’端进行HEX修饰,3’端进行BHQ1修饰;
在CYP2C9*2-CFP序列的第14位碱基C上增加锁核酸(LNA)的修饰;
在CYP2C9*2-TFP序列的第12位碱基T上增加锁核酸(LNA)的修饰;
在CYP2C9*3-AF序列的第15位碱基A上增加锁核酸(LNA)的修饰;
在CYP2C9*3-CFP序列的第13位碱基C上增加锁核酸(LNA)的修饰;
在VKORC1-GFP序列的第15位碱基C上增加锁核酸(LNA)的修饰;
在VKORC1-AFP序列的第11位碱基T上增加锁核酸(LNA)的修饰。
2.根据权利要求1所述的用于检测CYP2C9和VKORC1基因多态性的组合物,其特征在于,一人份加入量为:CYP2C9*2-F加入量0.1-0.3μL,CYP2C9*3-F加入量0.1-0.3μL,VKORC1-F加入量0.1-0.3μL,CYP2C9*2-R加入量0.1-0.3μL,CYP2C9*3-R加入量0.1-0.3μL,VKORC1-R加入量0.1-0.3μL,CYP2C9*2-CFP加入量0.01-0.2μL,CYP2C9*3-AFP加入量0.01-0.2μL,VKORC1-GFP加入量0.01-0.2μL,CYP2C9*2-TFP加入量0.01-0.2μL,CYP2C9*3-CFP加入量0.01-0.2μL,VKORC1-AFP加入量0.01-0.2μL,HER2-F加入量0.01-0.2μL,HER2-R加入量0.01-0.2μL,HER2-FP加入量0.01-0.2μL。
3.根据权利要求1或2所述的用于检测CYP2C9和VKORC1基因多态性的组合物在制备用于检测CYP2C9和VKORC1基因多态性的试剂中的应用。
4.一种用于检测检测CYP2C9和VKORC1基因多态性的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1或2所述的用于检测CYP2C9和VKORC1基因多态性的组合物。
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