[发明专利]一种基于微生物rRNA基因测序技术的菌群代谢功能预测分析方法

权利要求书

1.一种基于微生物rRNA基因测序技术的菌群代谢功能预测分析方法，其是通过将现有的16S rRNA基因测序数据与代谢功能已知的微生物参考基因组数据库相对比，从而实现对细菌和古菌代谢功能的预测；其特征在于，具体步骤如下：

(1)先根据已测微生物基因组的16S rRNA基因全长序列，推断它们的共同祖先的基因功能谱；

(2)对Greengenes数据库中其它未测物种的基因功能谱进行推断，构建古菌和细菌域全谱系的基因功能预测谱；

(3)将测序得到的菌群组成“映射”到数据库中，对菌群代谢功能进行预测。

2.如权利要求1所述的一种基于微生物rRNA基因测序技术的菌群代谢功能预测分析方法，其特征在于，所述步骤(3)具体通过以下方式实现：

(3.1)对测序获得的16S rRNA基因序列，进行“封闭式”参考OTU划分，通过与Greengenes数据库比对，寻找每一条测序序列的“参考序列最近邻居”，并归为参考OTU；

(3.2)根据“参考序列最近邻居”的rRNA基因拷贝数，对获得的OTU丰度矩阵进行校正；

(3.3)根据“参考序列最近邻居”对应的KEGG/EggNOG等基因功能谱数据，换算预测菌群的整体代谢功能。