[发明专利]一种快速鉴定多主棒孢菌对氟吡菌酰胺抗药性的方法及专用引物对有效
申请号: | 201710722560.1 | 申请日: | 2017-08-22 |
公开(公告)号: | CN107299147B | 公开(公告)日: | 2020-03-31 |
发明(设计)人: | 石延霞;朱发娣;李宝聚;谢学文;柴阿丽 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/04 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;白艳 |
地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 鉴定 多主棒孢菌 氟吡菌酰胺 抗药性 方法 专用 引物 | ||
1.检测多主棒孢菌基因组中的琥珀酸脱氢酶B亚基编码基因A1020G位点碱基的物质在检测多主棒孢菌对氟吡菌酰胺抗性中的应用;
所述A1020G位点为所述琥珀酸脱氢酶B亚基编码基因中第1020位;
所述A1020G位点的碱基为A或G。
2.检测多主棒孢菌基因组中的琥珀酸脱氢酶B亚基第280位氨基酸残基的物质在检测多主棒孢菌对氟吡菌酰胺抗性中的应用;
所述第280位氨基酸残基为所述琥珀酸脱氢酶B亚基氨基酸序列第280位;
所述第280位氨基酸残基为Ile或Val。
3.一种检测或辅助检测多主棒孢菌对氟吡菌酰胺抗性的方法,包括如下步骤:检测待测多主棒孢菌中基因组中的琥珀酸脱氢酶B亚基编码基因A1020G位点碱基,所述A1020G位点的碱基为A或G;若该位点的碱基为A,则该多主棒孢菌为或候选为对氟吡菌酰胺敏感;若该位点的氨基酸残基为G,则该多主棒孢菌为或候选为对氟吡菌酰胺具有抗性。
4.一种检测或辅助检测多主棒孢菌对氟吡菌酰胺抗性的方法,包括如下步骤:检测待测多主棒孢菌中基因组中的琥珀酸脱氢酶B亚基编码基因编码的蛋白第280位的氨基酸残基,所述第280位氨基酸残基为Ile或Val;若该位点的氨基酸残基为Ile,则该多主棒孢菌为或候选为对氟吡菌酰胺敏感;若该位点的氨基酸残基为Val,则该多主棒孢菌为或候选为对氟吡菌酰胺具有抗性。
5.一种检测或辅助检测多主棒孢菌对氟吡菌酰胺抗性的方法,包括如下步骤:检测待测多主棒孢菌中基因组中的琥珀酸脱氢酶B亚基编码基因A1020G位点碱基,所述A1020G位点的碱基为A或G;该位点的碱基为G的待测多主棒孢菌对氟吡菌酰胺的抗性高于该位点的碱基为A的待测多主棒孢菌。
6.一种检测或辅助检测多主棒孢菌对氟吡菌酰胺抗性的方法,包括如下步骤:检测待测多主棒孢菌中基因组中的琥珀酸脱氢酶B亚基编码基因编码的蛋白的第280位的氨基酸残基,所述第280位氨基酸残基为Ile或Val;该位点的氨基酸残基为Val的待测多主棒孢菌对氟吡菌酰胺的抗性高于该位点的氨基酸残基为异亮氨酸的待测多主棒孢菌。
7.根据权利要求3-6中任一所述的方法,其特征在于:
所述检测待测多主棒孢菌中基因组中的琥珀酸脱氢酶B亚基编码基因编码的蛋白第280位的氨基酸残基通过检测待测多主棒孢菌中基因组中的琥珀酸脱氢酶B亚基编码基因A1020G位点碱基实现;
所述检测待测多主棒孢菌中基因组中的琥珀酸脱氢酶B亚基编码基因A1020G位点碱基通过如下1)或2)方法实现:
1)测序;
2)用所述检测多主棒孢菌基因组中的琥珀酸脱氢酶B亚基编码基因A1020G位点碱基的物质扩增所述待测多主棒孢菌,检测扩增产物,若所述扩增产物得到特异片段,则所述检测待测多主棒孢菌中基因组中的琥珀酸脱氢酶B亚基编码基因A1020G位点碱基为G,若扩增产物未得到特异片段,则所述检测待测多主棒孢菌中基因组中的琥珀酸脱氢酶B亚基编码基因A1020G位点碱基为A;
所述检测多主棒孢菌基因组中的琥珀酸脱氢酶B亚基编码基因A1020G位点碱基的物质包括如下A或B:
A)扩增所述A1020G位点的引物对;
B)含有所述引物对的PCR试剂或试剂盒。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:
所述扩增所述A1020G位点的引物对由序列5所示的核苷酸和序列6所示的核苷酸组成;
或所述特异片段大小为250-270bp;
或所述扩增的退火温度为61.4-68.4℃。
9.权利要求7所述方法中的所述检测多主棒孢菌对氟吡菌酰胺抗性的物质。
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