[发明专利]利用形态标构建狗牙根核心种质的方法和装置有效
申请号: | 201710769189.4 | 申请日: | 2017-08-31 |
公开(公告)号: | CN107577920B | 公开(公告)日: | 2020-10-13 |
发明(设计)人: | 黄春琼;刘国道;白昌军 | 申请(专利权)人: | 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所 |
主分类号: | G16B20/00 | 分类号: | G16B20/00;G16B40/00 |
代理公司: | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 赵蕊红 |
地址: | 57173*** | 国省代码: | 海南;46 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 利用 形态 构建 牙根 核心 种质 方法 装置 | ||
1.一种利用形态标记构建狗牙根核心种质的方法,其特征在于,包括:
根据形态标记,测定狗牙根试验材料中狗牙根的性状,获得狗牙根原始种质的表型数据;
将取样方法、总体取样比例、聚类方法和遗传距离中包含的子策略进行两两组合,组合成的策略对所述原始种质进行种质的选取,获得狗牙根核心种质子集;
根据评价参数将每一个核心种质子集包含的种质的表型数据与原始种质的表型数据进行对比分析,从所述取样方法、所述总体取样比例、所述聚类方法和所述遗传距离中选取出相应的最优子策略;
将组内取样比例包含的子策略与所述选取出的四种类型最优的子策略进行组合,组合成的策略对分组后的原始种质的每一个小组进行种质的选取,并根据所述评价参数将所选取到的种质的表型数据与原始种质的表型数据进行对比分析,筛选出组内取样比例的最优子策略;
根据选取出的五种类型的最优子策略,从所述原始种质进行种质的选取,构建成狗牙根核心种质;
所述取样方法的子策略包括多次聚类优先取样法、多次聚类变异度取样法和不聚类完全随机法;
所述总体取样比例的子策略包括5%、10%、15%、20%、25%、30%和35%;
所述聚类方法的子策略包括最短距离法、最长距离法、中间距离法、不加权类平均法和离差平方和法;
所述遗传距离的子策略包括欧氏距离、马氏距离和主成分距离;
所述组内取样比例的子策略包括简单比例、平方根比例和对数比例;
所述评价参数包括均值差异百分率、方差差异百分率、极差符合率和变异系数变化率。
2.如权利要求1所述的利用形态标记构建狗牙根核心种质的方法,其特征在于,所述选取出的五种类型的最优子策略为:所述取样方法为多次聚类优先取样法,所述总体取样比例为20%,所述聚类方法为不加权类平均法,所述遗传距离为马氏距离,以及所述组内取样比例为平方根比例。
3.如权利要求1所述的利用形态标记构建狗牙根核心种质的方法,其特征在于,对所述原始种质进行分组的方法为:
根据植物学分类将所述原始种质分成相应的组类;
根据地理来源将每一组类内的原始种质进行划分,完成对所述原始种质的分组。
4.一种利用形态标记构建狗牙根核心种质的装置,其特征在于,包括:
表型数据测定模块,用于根据形态标记,测定狗牙根试验材料中狗牙根的性状,获得狗牙根原始种质的表型数据;
核心种质子集模块,用于将取样方法、总体取样比例、聚类方法和遗传距离中包含的子策略进行两两组合,组合成的策略对所述原始种质进行种质的选取,获得狗牙根核心种质子集;
第一策略选取模块,用于根据评价参数将每一个核心种质子集包含的种质的表型数据与原始种质的表型数据进行对比分析,从所述取样方法、所述总体取样比例、所述聚类方法和所述遗传距离中选取出相应的最优子策略;
第二略选取模块,用于将组内取样比例包含的子策略与所述选取出的四种类型最优的子策略进行组合,组合成的策略对分组后的原始种质的每一个小组进行种质的选取,并根据所述评价参数将所选取到的种质的表型数据与原始种质的表型数据进行对比分析,筛选出组内取样比例的最优子策略;
核心种质构建模块,用于根据选取出的五种类型的最优子策略,从所述原始种质进行种质的选取,构建成狗牙根核心种质;
所述取样方法的子策略包括多次聚类优先取样法、多次聚类变异度取样法和不聚类完全随机法;
所述总体取样比例的子策略包括5%、10%、15%、20%、25%、30%和35%;
所述聚类方法的子策略包括最短距离法、最长距离法、中间距离法、不加权类平均法和离差平方和法;
所述遗传距离的子策略包括欧氏距离、马氏距离和主成分距离。
所述组内取样比例的子策略包括简单比例、平方根比例和对数比例。
所述评价参数包括均值差异百分率、方差差异百分率、极差符合率和变异系数变化率。
5.如权利要求4所述的利用形态标记构建狗牙根核心种质的装置,其特征在于,所述选取出的五种类型的最优子策略为:所述取样方法为多次聚类优先取样法,所述总体取样比例为20%,所述聚类方法为不加权类平均法,所述遗传距离为马氏距离,以及所述组内取样比例为平方根比例。
6.如权利要求4所述的利用形态标记构建狗牙根核心种质的装置,其特征在于,还包括用于对所述原始种质进行分组的种质分组模块,所述种质分组模块包括:
植物学分组单元,用于根据植物学分类将所述原始种质分成相应的组类;
地理来源分组单元,用于根据地理来源将每一组类内的原始种质进行划分,完成对所述原始种质的分组。
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