[发明专利]用于通过细菌宏基因组分析来诊断胃癌的试剂盒和方法

权利要求书

1.一种用于提供用于胃癌诊断的信息的试剂盒，所述试剂盒包括：具有SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2的成对的引物；以及包括以下步骤的操作手册：

从分离自受试者样品的细胞外囊泡中提取DNA；

使用具有SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2的所述成对的引物对提取的所述DNA进行聚合酶链式反应(PCR)；以及

通过对PCR的产物进行测序，与来源于正常个体的样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量比较并确定所述受试者样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

2.根据权利要求1所述的试剂盒，其中所述比较并确定包括比较并确定来源于选自由脱铁杆菌门(Deferribacteres)、栖热菌门(Thermi)、蓝细菌门(Cyanobacteria)和广古菌门(Euryarchaeota)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

3.根据权利要求2所述的试剂盒，其中，如果在病例中来源于所述脱铁杆菌门(Deferribacteres)、栖热菌门(Thermi)、或蓝细菌门(Cyanobacteria)的所述细胞外囊泡的含量与来源于正常个体的样品的那些相比增加，或在病例中来源于所述广古菌门(Euryarchaeota)的细胞外囊泡的含量与来源于正常个体的样品的那些相比减少，则该病例被诊断为胃癌。

4.根据权利要求1所述的试剂盒，其中所述比较并确定包括比较并确定来源于选自红色杆菌纲(Rubrobacteria)、S085纲、ML635J-21纲、TG3纲、ABY1纲、脱铁杆菌纲(Deferribacteres)、异常球菌纲(Deinococci)、叶绿体纲(Chloroplast)、颤藻亚纲(Oscillatoriophycideae)、Gemm-3纲、以及甲烷杆菌纲(Methanobacteria)中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

5.根据权利要求4所述的试剂盒，其中，如果在病例中来源于所述红色杆菌纲(Rubrobacteria)、S085纲、ML635J-21纲、TG3纲、ABY1纲、脱铁杆菌纲(Deferribacteres)、异常球菌纲(Deinococci)、叶绿体纲(Chloroplast)、或颤藻亚纲(Oscillatoriophycideae)的细胞外囊泡的含量与来源于正常个体的样品的那些相比增加，或来源于所述Gemm-3纲或甲烷杆菌纲(Methanobacteria)的细胞外囊泡的含量与来源于正常个体的样品的那些相比减少，则该病例被诊断为胃癌。

6.根据权利要求1所述的试剂盒，其中所述比较并确定包括比较并确定来源于选自由根瘤菌目(Rhizobiales)、脱铁杆菌目(Deferribacterales)、奈瑟氏球菌目(Neisseriales)、异常球菌目(Deinococcales)、链形植物目(Streptophyta)、色球藻目(Chroococcales)、心杆菌目(Cardiobacteriales)、不等鞭毛目(Stramenopiles)、硫发菌目(Thiotrichales)、弧菌目(Vibrionales)、甲烷杆菌目(Methanobacteriales)和RF39目组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

7.根据权利要求6所述的试剂盒，其中，如果在病例中来源于所述根瘤菌目(Rhizobiales)、脱铁杆菌目(Deferribacterales)、奈瑟氏球菌目(Neisseriales)、异常球菌目(Deinococcales)、链形植物目(Streptophyta)、或色球藻目(Chroococcales)的细菌的细胞外囊泡的含量与来源于正常个体的样品的那些相比增加，或在病例中来源于所述心杆菌目(Cardiobacteriales)、不等鞭毛目(Stramenopiles)、硫发菌目(Thiotrichales)、弧菌目(Vibrionales)、甲烷杆菌目(Methanobacteriales)或RF39目的细菌的所述细胞外囊泡的含量与来源于正常个体的样品的那些相比减少，则该病例被诊断为胃癌。