[发明专利]一种瓦氏雅罗鱼DNA条形码标准检测序列及其应用有效

专利信息
申请号: 201710788949.6 申请日: 2017-09-04
公开(公告)号: CN107354226B 公开(公告)日: 2020-11-03
发明(设计)人: 孙博;苏宝锋;常玉梅;梁利群 申请(专利权)人: 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 哈尔滨市文洋专利代理事务所(普通合伙) 23210 代理人: 吴国清
地址: 150070 黑龙*** 国省代码: 黑龙江;23
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摘要:
搜索关键词: 一种 瓦氏雅罗鱼 dna 条形码 标准 检测 序列 及其 应用
【说明书】:

一种瓦氏雅罗鱼DNA条形码标准检测序列及其应用,涉及一种瓦氏雅罗鱼DNA条形码标准检测序列及其应用。本发明的目的在于提供一段瓦氏雅罗鱼DNA条形码标准检测序列及其在物种鉴定中的应用。该序列如序列表中SEQ ID NO:1所示。本发明所提供的瓦氏雅罗鱼DNA条形码标准检测序列有利于实现瓦氏雅罗鱼的分子鉴定,能有效缩短鉴定时间。本发明瓦氏雅罗鱼DNA条形码标准检测序列用于鉴定瓦氏雅罗鱼。

技术领域

本发明涉及瓦氏雅罗鱼DNA条形码标准检测序列及其应用。

背景技术

瓦氏雅罗鱼(Leuciscus waleckii)又名东北雅罗鱼,俗称华子鱼、滑鱼、白鱼,隶属于鲤形目、鲤科、雅罗鱼亚科的雅罗鱼属,是一种体型较小的冷水性经济鱼类。瓦氏雅罗鱼体长,呈纺锤形,侧扁,腹部圆,无皮棱;口端位,口列倾斜,上颌倾斜,较下颌长;唇薄,无须,无角质边缘;吻钝,稍隆起,吻长略大于眼径;眼中等大,鳃耙短小,鳞中等大,侧线完全,微向腹面弯下,向后延至尾柄正中轴;背鳍无硬刺;体背部及提上侧灰黑色,腹部银白,偶鳍和臀鳍为黄色,其余各鳍灰白色。

瓦氏雅罗鱼是一种普生种类,广泛分布于欧洲、西伯利亚、高加索、黑龙江流域的清冷水域。在中国分布于黑龙江、乌苏里江、嫩江、松花江、牡丹江以及其支流、湖泊、水库,也产于图们江、鸭绿江、辽河等水域。在黄河流域的河南、山西、陕西、甘肃、青海等省区也有分布。在内蒙古自治区除额济纳河水系以外,各大水系均有分布,达里湖数量最多。目前,对瓦氏雅罗鱼的物种识别仅局限于形态学鉴定,而能够鉴定的专业人员很少,这使得很多地区无法对瓦氏雅罗鱼进行准确的鉴定。因此,开发出瓦氏雅罗鱼有效的鉴定方法就显得尤为重要。

DNA条形码(DNA barcoding)是利用生物体DNA中一段保守片段对物种进行快速准确鉴定的新兴技术,能够快速、准确的进行物种鉴定。目前,在动物中最常见的分子标记是线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(cytochrome coxidase I,COI)基因的部分序列。DNA条形码具有广泛的应用前景,在物种的鉴定、分子进化、种群遗传、濒危物种保护等研究领域具有一定的发展潜力。DNA条形码不同于以往的传统鉴别方法,其操作简单,容易掌握,对研究人员的专业技能无较高要求。DNA条形码技术摆脱了传统形态鉴定方法依赖长期经验的障碍,可实现快速准确的鉴定,是分子鉴定方法学上的创新,操作简单、效率高、应用广等特点无意将改变整个物种鉴定领域的发展方向。运用DNA条形码技术,可以很好的对瓦氏雅罗鱼进行快速、有效的鉴定。

物种鉴定一直是分类学研究上至关重要的基础步骤。能够对物种进行准确的鉴定,特别是稀有经济物种和保护意义重大的种类,分类鉴定工作就显得尤为重要。自2003年,加拿大科学家Hebert提出以COI基因作为DNA条形码以来,越来越多的研究证明了DNA条形码在物种分类上具有高效的可行性。大量的研究结果证明了COI基因作为标记的DNA条形码能够准确的对各类动物进行物种鉴定,可以选用COI基因作为动物条形码数据库的标准条形码。

DNA条形码鉴定方法与传统的分类学方法相辅相成,不仅可以解决鉴定中标本残缺导致的无法辨识的问题,而且有利于快速鉴定。目前已有专门的鱼类数据库,包含了多种鱼类条形码数据。但是我国许多鱼类因其特有性,没有足够的相关数据。也没有瓦氏雅罗鱼的相关基因序列。

发明内容

本发明的目的在于提供一段瓦氏雅罗鱼DNA条形码标准检测序列及其在物种鉴定中的应用。本发明所提供的瓦氏雅罗鱼DNA条形码标准检测序列有利于实现瓦氏雅罗鱼的分子鉴定,能有效缩短鉴定时间。

本发明瓦氏雅罗鱼DNA条形码标准检测序列为COI基因,如序列表中SEQ ID NO:1所示。

本发明还提供用于检测上述瓦氏雅罗鱼DNA条形码标准检测序列的引物,包括正向引物5'-TCAACCAACCACAAAGACATTGGCAC-3'和反向引物5'-TAGACTTCTGGGTGGCCAAAGAATCA-3'。

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