[发明专利]检测MTB喹诺酮类药物耐药基因gyrA突变的试剂盒及其方法和用途在审
申请号: | 201710796497.6 | 申请日: | 2017-09-06 |
公开(公告)号: | CN109468393A | 公开(公告)日: | 2019-03-15 |
发明(设计)人: | 潘红超;卢守建;程乐华;马焕班;马腾飞;郭南南;李琰;赵琨;陈忠;黄士昂 | 申请(专利权)人: | 上海新培晶医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/04;C12R1/32 |
代理公司: | 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 | 代理人: | 张新鑫;许亦琳 |
地址: | 200025 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 试剂盒 结核分枝杆菌 喹诺酮类药物 检测引物 耐药基因 突变 特异性扩增 喹诺酮药物 快速鉴别 临床用药 种检测 检测 | ||
1.一种检测MTB喹诺酮类药物耐药基因gyrA突变的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒至少包括:gyrA基因检测引物,所述gyrA基因检测引物至少有3种,其序列分别如SEQ IDNO.1、SEQ ID NO.2以及SEQ ID NO.3所示。
2.根据权利要求1所述的检测MTB喹诺酮类药物耐药基因gyrA突变的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中包含两种独立包装的引物对,其中一个包装含有的引物如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示,另外一个包装含有的引物对如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.3所示。
3.根据权利要求1所述的检测MTB喹诺酮类药物耐药基因gyrA突变的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还含有无菌水、dNTP、PCR buffer、rTaq酶、样品基因组DNA提取试剂中的一种或多种。
4.根据权利要求1所述的检测MTB喹诺酮类药物耐药基因gyrA突变的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中还含有阳性对照,所述阳性对照为含有第88、90和94位密码子突变的结核分枝杆菌gyrA基因DNA样本。
5.如权利要求1~4任意项所述的试剂盒的使用方法,至少包括以下步骤:
(1)提取样品基因组DNA;
(2)将样品基因组DNA加入装有PCR反应体系的PCR管中,获得样品反应管,所述PCR反应体系中含有gyrA基因检测引物序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示;
(3)第一轮PCR反应:反应管置于PCR仪上,设置循环参数,进行PCR反应,获得第一轮PCR反应产物;
(4)取第一轮PCR反应产物作为第二轮PCR的模板,加入装有PCR反应体系的PCR反应管中,同时加入引物,引物序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.3所示;
(5)第二轮PCR反应:反应管置于PCR仪上,设置循环参数,进行PCR反应,获得第二轮PCR反应产物;
(6)PCR反应结束后,分析结果。
6.根据权利要求5所述的使用方法,其特征在于:所述步骤(3)中的反应条件设置为(a)95.0℃5min;(b)95℃30s;62℃30s;72℃40s,步骤(b)循环15次,每次循环的中间步骤比上次循环降低0.5°最终使得62°降落至55°,(c)95℃30s;55℃30s;72℃40s;步骤(c)循环25次;(d)72°10min。
7.根据权利要求1所述的使用方法,其特征在于步骤(5)中的反应条件与步骤(3)相同。
8.如权利要求1~4任意项权利要求所述的检测MTB喹诺酮类药物耐药基因gyrA突变的试剂盒在制备gyrA基因检测产品中的用途。
9.根据权利要求8所述的用途,其特征在于,所述检测产品用于检测和筛选耐喹诺酮类药物的结核分枝杆菌。
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