[发明专利]一组用于区分芝麻13对染色体的BAC标记有效

专利信息
申请号: 201710805923.8 申请日: 2017-09-08
公开(公告)号: CN107541553B 公开(公告)日: 2021-06-04
发明(设计)人: 苗红梅;张海洋;赵瑞红;马琴;李春;魏利斌;段迎辉;徐芳芳;琚铭;常淑娴 申请(专利权)人: 河南省农业科学院芝麻研究中心
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6841;C12N15/11
代理公司: 郑州联科专利事务所(普通合伙) 41104 代理人: 时立新
地址: 450000 河*** 国省代码: 河南;41
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摘要:
搜索关键词: 一组 用于 区分 芝麻 13 染色体 bac 标记
【权利要求书】:

1.一组用于区分芝麻13对染色体的BAC标记,其特征在于,该BAC组标记共包括16个BAC标记,BAC双末端碱基序列信息如SEQ ID NO.1、2、5~34所示;

其中,探针名称中“G”表示该探针为绿色荧光标记,“R”表示该探针为红色荧光标记。

2.利用权利要求1所述BAC标记区分芝麻13对染色体的区分方法,其特征在于,包括如下操作步骤:

(一)芝麻染色体标本制备

以芝麻根尖作为样品,制备根尖染色体片标本;

(二)制备BAC探针

对所述用于区分13对芝麻染色体的BAC标记进行荧光标记;

(三)荧光原位杂交

利用步骤(二)中标记后的BAC探针对步骤(一)中的染色体标本进行标记;

(四)区分染色体

对步骤(三)中最后BAC-FISH杂交结果图片进行整合分析,对13条芝麻染色体进行编号并进行区分;具体区分时,参考如下芝麻13个染色体组核型进行区分:

在对芝麻13对染色体进行区分时,Chr.2、Chr.4和Chr.7上各有2个特异BAC标记,其余10对染色体上各有1个特异BAC标记;

53G探针标记在1号染色体的短臂区;

87R、48G探针标记在2号染色体的长臂区;

25G探针标记在3号染色体的短臂区;

39G、15R探针标记在4号染色体的短臂区;

42R探针标记在5号染色体的长臂区;

102R探针标记在6号染色体的短臂区;

76R、21R探针标记在7号染色体的长臂区;

57G探针标记在8号染色体的长臂区;

3R探针标记在9号染色体的长臂近着丝粒区;

31G探针标记在10号染色体的短臂区;

4G探针标记在11号染色体的长臂区;

68R探针标记在12号染色体的长臂区;

54R探针标记在13号染色体的长臂区。

3.如权利要求2所述的区分芝麻13对染色体的区分方法,其特征在于,步骤(一)中,以豫芝11号种子的1.2~1.8cm根尖作为样品,制备芝麻染色体标本。

4.如权利要求3所述的区分芝麻13对染色体的区分方法,其特征在于,制备芝麻染色体标本时,按如下步骤进行制备:

(1)取健康芝麻种子,播于铺有湿滤纸的培养皿中,21℃暗培养长根;

(2)取1.2~1.8cm长根尖,将4~5mm根尖顶端部位切下,并置于玻瓶中,加入0.002M 的8-羟基喹啉中,21℃避光预处理1h,转移根尖至固定液中,4℃固定1h;

(3)蒸馏水浸洗2~3次后,切取1mm左右处根尖分生区,然后每10个根尖分生区加入20µL混合酶液,35~40℃酶解2~3h;

(4)随后取出根尖分生区,蒸馏水中浸洗10~20 min;将根尖分生区置于固定液,4℃固定1 h;

(5)取根尖分生区,置于预冷洁净玻片上,制成局部细胞悬液;然后滴加固定液使悬液分散于整个玻片,自然晾干;

(6)用吉姆萨染液染色15 min,然后自来水冲洗,自然晾干;

荧光显微镜下,挑选高质量染色体标本,并标记目标染色体所在区域,记录每组染色体对应的坐标位置。

5.如权利要求2所述的区分芝麻13对染色体的区分方法,其特征在于,步骤(二)中,采用随机引物法进行BAC探针标记。

6.如权利要求2所述的区分芝麻13对染色体的区分方法,其特征在于,步骤(三)中,荧光原位杂交时,采用BAC-FISH连续杂交技术。

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