[发明专利]一种恒温条件下合成核酸的方法及试剂盒有效
申请号: | 201710828028.8 | 申请日: | 2017-09-14 |
公开(公告)号: | CN107446919B | 公开(公告)日: | 2020-04-28 |
发明(设计)人: | 杜昱光;毛瑞 | 申请(专利权)人: | 中科芯瑞(苏州)生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/6806 |
代理公司: | 上海硕力知识产权代理事务所(普通合伙) 31251 | 代理人: | 刘红梅 |
地址: | 215152 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 恒温 条件下 合成 核酸 方法 试剂盒 | ||
1.一种非诊断目的的恒温条件下合成核酸的方法,包括以下步骤:
1)提供一种核酸,所述核酸的5’末端具有可与同一条链上的N区退火的Nc区,同时该核酸的3’末端具有可与同一条链上的N区退火的Nc区,此核酸的5’末端和3’末端所具有的Nc区与同一链上的N区退火存在竞争关系;
2)以步骤1)所述核酸为模板,将已与N区退火的Nc区的3’端为合成起点,合成其自身的互补核酸链;
3)通过聚合酶催化链置换型互补链合成反应进行互补链合成,以置换步骤2)中所合成的互补核酸链。
2.根据权利要求1所述的一种恒温条件下合成核酸的方法,其特征在于,具体包括以下步骤:
1)提供一种核酸的步骤,该核酸的5’末端和3’末端均具有能够与同一条链上的N区退火的Nc区;所述3’末端的Nc区与N区退火时能形成环,所述环包含能进行碱基配对的F1c区;所述5’末端的Nc区与N区退火时能形成环,所述环包含能进行碱基配对的R1区;所述核酸的5’末端和3’末端所具有的Nc区与同一链上的N区的退火存在竞争关系;
2)使第一寡核苷酸I与步骤1)提供的所述核酸的F1c区退火,然后以所述第一寡核苷酸I的F1区作为合成起点,进行合成步骤;其中所述第一寡核苷酸I包括N区与Fl区;
3)以步骤1)提供的所述核酸为模板合成其自身的互补链,将已与N区退火的Nc区的3’端为合成起点;将合成完后的核酸序列称为核酸A;
4)使第二寡核苷酸II与步骤3)提供的所述核酸A的R1c区退火,然后以所述第二寡核苷酸II的R1区作为合成起点,进行合成步骤;其中所述第二寡核苷酸II包括R1区和Nc区;
5)以步骤3)提供的所述核酸A为模板合成其自身的互补链,将3’端已与Nc区退火的N区为合成起点,获得在其一条链上具有首尾互补核苷酸序列的核酸链,并且该核酸链上具有交替连接的互补核苷酸序列区。
3.根据权利要求1所述的恒温条件下合成核酸的方法,其特征在于,步骤1)所述核酸的制备方法,包括以下步骤:
1-1)退火步骤,使第一寡核苷酸I与模板的F1c区退火,其中所述模板的3’末端包括F1c区和位于F1c区5’侧的N区,该模板的5’末端包括R1区,其中所述第一寡核苷酸I包括N区与Fl区,所述N区与F1区的5’侧相连,其中,
F1区:具有与F1c区互补的核苷酸序列的区,
N区:与Nc区互补的核苷酸序列的区;
1-2)以所述第一寡核苷酸I的F1区作为合成起点,合成第一核酸;所述第一核酸具有与所述模板互补的核苷酸序列,所述第一核酸的5’末端具有可与同一条链上的Nc区退火的N区,并且通过所述Nc区与N区的退火可形成茎环;
1-3)利用聚合酶催化链置换反应置换获得步骤1-2)所合成的第一核酸;
1-4)退火步骤,使第二寡核苷酸II与步骤1-3)所得第一核酸的R1c区退火,其中所述第二寡核苷酸II包括R1区和Nc区,并且Nc区与R1区的5’侧相连;其中,
R1区:具有与R1c区互补的核苷酸序列的区,
Nc区:与N区互补的核苷酸序列的区;
1-5)以所述第二寡核苷酸II的R1区作为合成的起点,合成第二核酸;
1-6)利用聚合酶催化链置换反应置换所述第二核酸获得步骤1)所述的核酸。
4.根据权利要求3所述的恒温条件下合成核酸的方法,其特征在于:步骤1-1)所述模板为RNA,步骤1-2)中的第一核酸通过具有反转录酶活性的酶来合成。
5.根据权利要求2-4任一项所述的恒温条件下合成核酸的方法,其特征在于:所述F1c区、N区和R1区的核酸片段均为15-60bp。
6.根据权利要求1或2所述的恒温条件下合成核酸的方法,其特征在于:所述获得的核酸链能够自主配对无限延伸,该核酸链上3’端的Nc区会与该链上的互补区段N区配对作为合成起点以自身为模板使所述核酸链不断延伸。
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