[发明专利]一种检测立氏立克次体的RPA方法、其专用引物和探针及用途有效
申请号: | 201710850529.6 | 申请日: | 2017-09-20 |
公开(公告)号: | CN107723375B | 公开(公告)日: | 2021-03-30 |
发明(设计)人: | 齐永;李越希;邵银秀;尹琼;曹勇平;陈红霞;陈乐如;饶继先;李佳萌;沈万鹏;李素芹;徐亭亭;杨彬彬 | 申请(专利权)人: | 李佳萌 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/01 |
代理公司: | 南京品智知识产权代理事务所(普通合伙) 32310 | 代理人: | 奚晓宁;杨陈庆 |
地址: | 210002 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 立克次体 rpa 方法 专用 引物 探针 用途 | ||
1.一种用于检测立氏立克次体的RPA专用引物和探针,是根据立氏立克次体特异性保守序列设计的,所述立氏立克次体特异性保守序列如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列,
SEQ ID NO.1:
AAGATAATTAATCGCTTATTATTAAAAATTTTCATTTTTTTATTATTTATTACTAGCAATAATCTGTGTTATTTGATAAAATTAAATCTAAAAGAAAGGGAAAGTGTATGAGTAATATTAACGCTAAGTTTTACATACCATTGGTGTCACTACTTGGTGTATTCATTTATTTACTAAATTGTTTTAATAAAATATCTCAGTGTTCTTTAGTATTTGTGTTTTTAGCTATAACTACCAATATTATATCTGAGCTATATGGTAGAAAGAGAGCTTTGATTGCTGTGGCGTTATGTATAATAGTAAGTTTTGGTTTGTTATGGAACTTCAATTATTATATTCATGGTCGTGTTATTAAAGGAGTTGTTTTTGCATCTTTTGTATCTGTATTATTATCAACATATTGTAGTACAAGTATATTTTCACAACTTAAGCCAAGATGTTCTTTGAATACAAGAAATTTTGCTAGTTTAATAATGTGTGCGGTCGTAGATGGTATTGTGATGTCAGGATTTTTTGTAAATGTATTCTCTACAAGTAAAGTTTTGTCGATATTTTATAAAGAAGTATTATATAAATGTGCATATTCATTAACAGTTTATATCTGTATATTTTTAGTTCAAAAAGTATATGGCAATAATGGGAGTGTCCGCGCACTGAAAAATTTTTGAATAAAAAATATAGCTAACCT;
所述引物中的正向引物如SEQ ID NO.2所示的寡核苷酸序列,反向引物如SEQ ID NO.3所示的寡核苷酸序列,且5’端标记生物素(Biotin),
SEQ ID NO.2:5’ CTAGCAATAATCTGTGTTATTTGATAAAAT 3’,
SEQ ID NO.3:5’ ACAAAAGATGCAAAAACAACTCCTTT 3’,该探针如SEQ ID NO.4所示的寡核苷酸序列,且5’端标记荧光素,3’端添加延伸阻断基团,在第30-31位碱基之间增加一个四氢呋喃(THF);
SEQ ID NO.4:
5’ TACATACCATTGGTGTCACTACTTGGTGTA[THF]TCATTTATTTACTAA 3’ 。
2.根据权利要求1所述的引物和探针,其特征在于:所述探针由荧光素、5’端序列、四氢呋喃(THF)、3’端序列及3’端延伸阻断基团组成。
3.根据权利要求1所述的引物和探针,其特征在于:所述的荧光素为羧基荧光素FAM或FITC等其他荧光素,所述的延伸阻断基团为磷酸基团或其他阻断基团。
4.根据权利要求1所述的引物和探针,其特征在于:所述探针的长度为45bp,其中5’端30bp,3’端15bp。
5.权利要求1-4中任一项所述的引物和探针在制备立氏立克次体RPA检测试剂中的应用。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于:所述应用中用于50μL的RPA反应体系的试剂,所述的正向引物的浓度为10μmol/L,反向引物的浓度为10μmol/L,所述的探针的浓度为5μmol/L、镁离子浓度280μmol/L,模板加样量为1μL;将2.1μL正向引物、2.1μL反向引物、0.6μL探针、1μL样品、12.2μL无DNase 和RNase 水和29.5μL缓冲液组成预混液,加到含有冻干酶粉的0.2mL的TwistAmp nfo反应管中,然后将2.5μL的醋酸镁溶液加到反应管的盖子上;将反应管盖子上的醋酸镁溶液甩下,充分混匀后37℃ 扩增20min,在反应4min,将反应管取出充分混匀,放回反应装置中继续扩增;检测时加样量为5μL,试纸条显色时间控制在3 -5min。
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