[发明专利]一种饮用水中隐孢子虫的检测方法及试剂盒在审
申请号: | 201710884045.3 | 申请日: | 2017-09-26 |
公开(公告)号: | CN107586864A | 公开(公告)日: | 2018-01-16 |
发明(设计)人: | 李红岩;杨敏;李春格;李罗英;于志勇 | 申请(专利权)人: | 中国科学院生态环境研究中心 |
主分类号: | C12Q1/6893 | 分类号: | C12Q1/6893;C12N15/10 |
代理公司: | 北京风雅颂专利代理有限公司11403 | 代理人: | 张拥 |
地址: | 100085*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 饮用 水中 孢子 检测 方法 试剂盒 | ||
1.一种饮用水中隐孢子虫的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)饮用水的前处理
采用过滤器过滤饮用水,过滤器内的滤膜截留饮用水中微生物,然后采用有机溶剂溶解滤膜,待滤膜完全溶解后,加入缓冲液沉淀微生物,离心回收沉淀物;
(2)水样DNA提取
将沉淀物涡旋后形成悬浮物,加入裂解液进行冻融前处理,冻融前处理完成后加入蛋白酶用于破坏隐孢子虫卵囊外部结构,离心取上清液,上清液用于提取隐孢子虫卵囊DNA;
(3)qPCR检测
采用qPCR方法对隐孢子虫卵囊DNA进行扩增,根据扩增结果判断饮用水中是否感染了隐孢子虫,并能确定感染量。
2.根据权利要求1所述的饮用水中隐孢子虫的检测方法,其特征在于,步骤(1)中所述滤膜为1~2μm孔径的混合醋酸纤维素滤膜,所述过滤器为盘式过滤器,所述有机溶剂为丙酮;所述缓冲液为磷酸盐缓冲液。
3.根据权利要求2所述的饮用水中隐孢子虫的检测方法,其特征在于,采用丙酮溶解滤膜的具体步骤为:收集滤膜于离心管中,加入丙酮,离心弃上清液,继续加入丙酮,再离心取沉淀,重复此操作2~3次,直至滤膜完全溶解。
4.根据权利要求2所述的饮用水中隐孢子虫的检测方法,其特征在于,在收集滤膜之前还包括以下步骤:依次用PBST缓冲液、体积分数为70%~100%的乙醇、超纯水清洗过滤器。
5.根据权利要求1所述的饮用水中隐孢子虫的检测方法,其特征在于,步骤(2)中所述裂解液为ATL裂解液,所述裂解液与所述悬浮物的体积比为2.25:1;所述冻融前处理为在液氮和沸水中反复冻融5次,每次冻融为在液氮中2min,在沸水中2min。
6.根据权利要求1所述的饮用水中隐孢子虫的检测方法,其特征在于,步骤(2)中所述蛋白酶为蛋白酶K,所述蛋白酶K与EP管中混合液的体积比为1:10;加入蛋白酶用于破坏隐孢子虫卵囊外部结构的具体步骤为:冻融前处理完成后加入蛋白酶K,55~60℃下水浴2.5~3.5h,然后在88~92℃下水浴15~25min,取出后冰浴1.0~1.5min;采用QIAamp DNA mini kit试剂盒提取上清液中的隐孢子虫卵囊DNA。
7.根据权利要求1所述的饮用水中隐孢子虫的检测方法,其特征在于,步骤(3)中所述qPCR方法为SYBR green染料法qPCR或Taqman探针法qPCR,SYBR green染料法qPCR和Taqman探针法qPCR所使用的引物对均为JVAF引物和JVAR引物,Taqman探针法qPCR所使用的探针为隐孢子虫探针,所述JVAF引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:1所示,所述JVAR引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:2所示,所述隐孢子虫探针的核苷酸序列为SEQ ID NO:3所示。
8.根据权利要求1所述的饮用水中隐孢子虫的检测方法,其特征在于,根据扩增结果判断饮用水中是否感染了隐孢子虫的方法为:当扩增结果有Ct值时,则判断为阳性样品,表明饮用水中感染了隐孢子虫;当扩增结果无Ct值时,则判断为阴性样品,表明饮用水中没有感染隐孢子虫。
9.一种饮用水中隐孢子虫的检测试剂盒,其特征在于,包括SEQ ID NO:1所示的JVAF引物,SEQ ID NO:2所示的JVAR引物,蛋白酶K,ATL裂解液,2×power SYBR green Master mix,使用说明书,阳性对照,阴性对照;所述阳性对照为克隆有SSU rRNA基因的pMD18-T载体,所述阴性对照为无RNA酶与DNA酶的ddH2O。
10.一种饮用水中隐孢子虫的检测试剂盒,其特征在于,包括SEQ ID NO:1所示的JVAF引物,SEQ ID NO:2所示的JVAR引物,SEQ ID NO:3所示的隐孢子虫探针,ATL裂解液,Universal Master MixⅡ,使用说明书,阳性对照,阴性对照;所述阳性对照为克隆有SSU rRNA基因的pMD18-T载体,所述阴性对照为无RNA酶与DNA酶的ddH2O。
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