[发明专利]一种获得中国人群男性个体年龄的方法和系统有效
申请号: | 201710899133.0 | 申请日: | 2017-09-28 |
公开(公告)号: | CN109593862B | 公开(公告)日: | 2022-04-15 |
发明(设计)人: | 丰蕾;赵蕾;刘凡;李姗飞;彭付端;季安全 | 申请(专利权)人: | 公安部物证鉴定中心 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888 |
代理公司: | 北京同立钧成知识产权代理有限公司 11205 | 代理人: | 彭雪瑞;黄健 |
地址: | 100038 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 获得 中国 人群 男性 个体 年龄 方法 系统 | ||
1.一种获得中国人群男性个体年龄的方法,其特征在于,包括:
1)提取所述男性个体的DNA;
2)获得所述DNA以下9个CpG位点的甲基化率,所述9个CpG位点为:CpG1,CpG2,CpG3,CpG4,CpG5,CpG6,CpG7,CpG8和CpG9;采用与所述9个CpG位点一一对应的9对扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物;所述扩增引物为序列表中SEQ ID No.1至SEQ ID No.18的核苷酸序列;其中,所述9个CpG位点信息如下:
3)利用所述9个CpG位点中的甲基化率,采用R软件,对9个CpG位点与年龄进行回归分析,构建回归模型,以获得所述中国人群男性个体年龄;
所述回归模型为:
Y= 29.31+31.863*CpG1′–37.797*CpG2′–17.163*CpG3′–20.293*CpG4′ +32.982*CpG5′+29.76*CpG6′+33.684*CpG7′–28.528*CpG8′ +33.212*CpG9′,其中CpG1′,CpG2′,CpG3′,CpG4′,CpG5′,CpG6′,CpG7′,CpG8′和CpG9′分别为所述9个CpG位点的甲基化率。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤2)还包括在获得扩增产物后,使用质谱检测法获得所述9个CpG位点的甲基化率的步骤。
3.一种获得中国人群男性个体年龄的系统,其特征在于,所述系统包括DNA提取体系,复合扩增检测体系,数据获取体系;
所述DNA提取体系用于提取所述男性个体的DNA;
所述复合扩增检测体系用于对所述DNA的9个CpG位点进行扩增,并利用扩增产物获得所述CpG位点的甲基化率,所述9个CpG位点为:CpG1,CpG2,CpG3,CpG4,CpG5,CpG6,CpG7,CpG8和CpG9;所述复合扩增检测体系包括采用与所述9个CpG位点一一对应的9对扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物,所述扩增引物为序列表中SEQ ID No.1至SEQ ID No.18的核苷酸序列;其中,所述9个CpG位点信息如下:
所述数据获取体系用于由所述各CpG位点的甲基化率,采用R软件,对9个CpG位点与年龄进行回归分析,构建回归模型,以获得所述中国人群男性个体年龄。
4.根据权利要求3所述的系统,所述回归模型为:
Y= 29.31+31.863*CpG1′–37.797*CpG2′–17.163*CpG3′–20.293*CpG4′ +32.982*CpG5′+29.76*CpG6′+33.684*CpG7′–28.528*CpG8′ +33.212*CpG9′,其中CpG1′,CpG2′,CpG3′,CpG4′,CpG5′,CpG6′,CpG7′,CpG8′和CpG9′分别为所述9个CpG位点的甲基化率。
5.根据权利要求3所述的系统,其特征在于,所述复合扩增检测体系用于采用与所述9个CpG位点一一对应的9对扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物,并利用所述扩增产物使用质谱检测法获得所述9个CpG位点的甲基化率。
6.一种获得中国人群男性个体年龄的复合扩增检测体系,其特征在于,所述体系包括所述男性个体的DNA,9个CpG位点以及扩增引物,
所述复合扩增检测体系用于利用扩增引物扩增所述男性个体的DNA的9个CpG位点以获得扩增产物,并利用所述扩增产物通过质谱检测法获得所述9个CpG位点的甲基化率;
所述9个CpG位点为:CpG1,CpG2,CpG3,CpG4,CpG5,CpG6,CpG7,CpG8和CpG9;其中,所述9个CpG位点信息如下:
所述扩增引物由与所述9个CpG位点一一对应的9对扩增引物组成,所述扩增引物为序列表中SEQ ID No.1至SEQ ID No.18的核苷酸序列。
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