[发明专利]RT-qPCR检测树鼩SLC2A9/Glut9基因转录水平的方法在审

专利信息
申请号: 201710902507.X 申请日: 2017-09-29
公开(公告)号: CN109402228A 公开(公告)日: 2019-03-01
发明(设计)人: 唐东红;叶尤松;王陈芸;李哲丽;肖涵;邱炳玲;陈倩;杨浩;杨忠;马开利;鲁帅尧 申请(专利权)人: 中国医学科学院医学生物学研究所
主分类号: C12Q1/6851 分类号: C12Q1/6851;C12Q1/6888
代理公司: 昆明正原专利商标代理有限公司 53100 代理人: 徐玲菊
地址: 650118 云*** 国省代码: 云南;53
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摘要:
搜索关键词: 基因转录水平 肾脏组织 检测 实时定量PCR 总RNA为模板 基因片段 可重复性 扩增效率 内参基因 特异性强 有效途径 均一化 灵敏性 逆转录 扩增 溶解 合成 基因 新鲜 研究
【权利要求书】:

1.一种RT-qPCR检测树鼩SLC2A9/GLUT9基因转录水平的方法,其特征在于包括下列步骤:

(1)设计下列引物:

树鼩SLC2A9/GLUT9基因表达水平的特异性上、下游引物为:

SLC2A9/GLUT9 F:5’- ACAATGAAGCAGGAGCGACA -3’

SLC2A9/GLUT9 R:5’- ACTCAGGGTGATGTACGGGA-3’

作为内参基因的树鼩GAPDH基因的特异性上、下游引物为:

GAPDH F:5'-AGCCCCATCACCATCTTCC-3'

GAPDH R:5'- AATGAGCCCCAGCCTTCTC -3';

(2)以树鼩新鲜肾脏组织提取的总RNA为模板,按常规逆转录合成得树鼩肾脏组织cDNA第一链;

(3)以步骤(2)的树鼩肾脏组织cDNA第一链为cDNA模板,以步骤(1)中的SLC2A9/GLUT9F和SLC2A9/GLUT9R上、下游引物以及GAPDH F和GAPDH R上、下游引物为特异性引物,分别在下列PCR扩增体系及反应条件下进行实时荧光定量PCR扩增,扩增结束后根据荧光信号的数据,分别获得SLC2A9/GLUT9基因片段及内参基因GAPDH片段的Ct值及溶解峰;

所述PCR扩增体系及反应条件如下:

PCR扩增体系即25μL体系:

SYBR Premix Ex Taq II 酶 12.5μL,cDNA模板1μL,SLC22A12/URAT1 F和SLC22A12/URAT1 R上、下游引物各1μL,去离子水9.5μL;

SYBR Premix Ex Taq II 酶 12.5μL,cDNA模板1μL,GAPDH F和GAPDH R上、下游引物各1μL,去离子水9.5μL;

反应条件:94℃预变性30s,94℃变性5s、60℃退火30s、40个循环,59℃到94℃每5s采集一次荧光信号;

(4)将步骤(2)的树鼩肾脏组织cDNA第一链稀释为100、10-1、10-2、10-3、10-4倍浓度作为cDNA模板,以步骤(1)中的SLC2A9/GLUT9 F和SLC2A9/GLUT9R上、下游引物以及GAPDH F和GAPDH R上、下游引物为特异性引物,分别按步骤(3)的PCR扩增体系及反应条件进行荧光定量PCR扩增,反应结束后根据荧光信号的数据,获得Ct值,通过qPCR仪器自带CFXManager 软件建立SLC2A9/GLUT9基因及内参基因GAPDH的溶解曲线及标准曲线,得到SLC2A9/GLUT9基因片段及内参基因GAPDH片段的扩增效率、斜率及R2 值;

(5)在步骤(3)的PCR扩增体系及反应条件下,以步骤(2)的树鼩肾脏组织cDNA第一链作为待测样品cDNA模板,进行实时荧光定量PCR扩增,得到对应的Ct值,将该Ct值以及步骤(4)得到的SLC2A9/GLUT9基因及内参基因GAPDH的扩增效率,通过qPCR仪器自带CFX Manager软件处理,得出均一化后的SLC2A9/GLUT9基因倍数表达的ΔΔC(t)值,从而获得SLC2A9/GLUT9基因转录水平相对表达值。

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